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【求助】怎样固定某个分子(不优化)优化其它分子 ?
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oyljw
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【求助】怎样固定某个分子(不优化)优化其它分子 ?
请问: 想优化两个分子之间的相互作用,能把某个分子固
定住(不优化)先优化另一个分子吗?这是冻结核吗?
想固定优化,需要把坐标后面加上0,还需不需要其他的?
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独立之精神自由之思想
1楼
2010-10-25 13:09:06
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oyljw
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7楼
:
Originally posted by
29050801
at 2013-11-16 09:01:45
为什么采用-1 0的方法优化
优化结束后发现优化过程当中设置成固定的原子也存在部分移动呢?
不知道啊 我就用过一次啊 结果符合我的要求(收敛 并且结构不散架子)我没仔细看变没变化啊,我觉得变化一点也没关系吧
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独立之精神自由之思想
8楼
2013-11-16 11:17:24
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oyljw(金币+2):谢谢您的回复 2010-10-25 14:17:57
你直接把另一个分子的所有原子都固定就可以了
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惺惺相惜情不自禁
2楼
2010-10-25 13:21:46
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这是冻结原子不参加优化。
需要把坐标中的原子后面空格之后加上“-1”
例子
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独立之精神自由之思想
3楼
2010-10-25 18:37:08
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oyljw(金币+1): 2010-10-25 20:42:24
oyljw(金币+1): 2010-10-26 11:11:34
去看版主的FAQ 上面有!
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拒稿,终于体会到了!乱写接受,认真写拒稿,这就是2和4的区别吗?
4楼
2010-10-25 18:45:53
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