应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】淀粉酶吸附
111/2返回列表12下一页
查看: 1676  |  回复: 17
查看全部回帖 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

leiyinwill

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】淀粉酶吸附 已有4人参与

看很多文献上面说淀粉酶对淀粉的降解一般都与淀粉酶和淀粉的吸附呈正相关。然而我最近做的却不是那么回事，现在就在查找这方面的文献。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
好好做实验！
1楼 2010-09-23 16:37:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
生淀粉酶？
回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
2楼2010-09-23 19:11:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
淀粉酶对淀粉的降解一般都与淀粉酶和淀粉的吸附呈正相关

只是说一般，没有说你的就是那样，正常
赞一下 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2010-09-23 22:05:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
楼上的朋友能不能举例说明生淀粉酶降解生淀粉的碰撞理论？我才疏学浅不知道。

[ Last edited by 冼亮淀粉酶 on 2010-9-25 at 01:54 ]
赞一下(1人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
6楼2010-09-25 01:51:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2):鼓励交流~ 2010-10-12 10:20:37
The starch-binding domain from glucoamylase disrupts the structure of starch

Stacey M. Southall, Peter J. Simpson, Harry J. Gilbert, Gary Williamson,
Michael P. Williamson
1999年的文章，不过影响因子较高。话说楼主过这么久了，对于这个问题有什么新的看法也一起分享下嘛！

由于我暂时不做生淀粉酶，所以对生淀粉酶吸附和降解生淀粉的了解暂时限于这篇文章，文中说生淀粉酶降解生淀粉需要SBD去改变生淀粉晶体的结构，看起来不仅仅是与steric factor, collision frequency, media viscosity,particle size 这些因素有关那么简单，我认为这些因素更适合没有SBD的淀粉酶。如果非要说有关系，那就是吸附使collision frequency增大，就像核糖体结合在mRNA上使得翻译效率更高（不知道我这个举例恰不恰当）。

而且不是所有能够降解生淀粉的淀粉酶都有SBD的，有的没有SBD的淀粉酶降解非生淀粉更快，降解生淀粉就是蜗牛，并不是不能降解。至于吸附与降解是否为正相关，各人做法不一定完全相同，所得结果不同也正常，而且这个做法也只是习惯做法，里面还有些非人为可以控制的因素，就像是都是1克淀粉，你说马铃薯生淀粉和木薯生淀粉哪个的生淀粉分子数量多？这里面涉及品种（品种都可能有上百种了）、颗粒大小、预处理，甚至打粉的时候或者烘烤的时候一部分生淀粉已经变性不是生淀粉晶体也有可能（这两种生淀粉的变性温度不一样的），所以不必对自己的实验结果太纠结。而且人家也就是说一般规律，没包括你自己的实验。

顺便附上我找到的Collision theory资料，当是学习一下。网页上说该概念是1916年提出的，距今差不多百年。楼上朋友说该理论是目前比较通用的，我猜想可能是理论体系与时俱进，不断丰富，所以生命力持久至今，我也觉得是可取的，只是需要具体情况具体分析。
网址为http://en.wikivisual.com/index.php/Collision_theory

Collision theory is a theory, proposed by Max Trautz and William Lewis in 1916 that qualitatively explains how chemical reactions occur and why reaction rates differ for different reactions.IUPAC Goldbook definition of Collision Theory It assumes that for a reaction to occur the reactant particles must collide, but only a certain fraction of the total collisions, the effective collisions, cause the transformation of reactant molecules into products. This is due to the fact that only a fraction of the molecules have sufficient energy and the right orientation at the moment of impact to break the existing bonds and form new bonds. The minimal amount of energy needed so that the molecule is transformed is called activation energy. Collision theory is closely related to chemical kinetics.
赞一下(2人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
7楼2010-10-03 19:47:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by lwiaanngg at 2010-09-25 00:10:52:
这个和吸附无关。应该说是碰撞，也就是酶反应中目前比较通用的collision theory。酶和底物之间的有效碰撞决定于反应效率
Kcoff和你的steric factor, collision frequency, media viscosity,particle size 相关。 ...

差点忘记，要引用了才能让对方知道有人对他回过的帖子有兴趣，不然我说那么多都没用。
赞一下(1人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
8楼2010-10-03 21:05:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by lwiaanngg at 2010-10-04 09:39:58:



看到了你的回复，我不知道你是什么背景的。但是，不论你用的是什么，淀粉酶也罢，糖化酶也罢，如果你从反应的机理来说，collision theory都更好的解释，这个应该才是目前反应工程解释酶反应的基本把，那篇文 ...

能够吸附就更加增加了碰撞几率，这一点你是否同意？SBD也有解离常数，生淀粉酶降解生淀粉属于化学反应，容不容易吸附到生淀粉螺旋链上也是受steric factor, collision frequency, media viscosity,particle size 这些因素影响的，我没有否认这个理论，只是说这个理论会随着时间的推移而丰富，并且具体到某些反应上会有其特有的发展。就像社会主义理论体系在中国和别的国家的实现会有差别一样。
赞一下(1人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
10楼2010-10-04 13:25:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2):再加分~呵呵 2010-10-12 10:21:26
论文中设计过实验，说明G1和G2对生玉米淀粉的降解速率不同，G2和G2+SBD对生玉米淀粉的降解速率不同，假如用Collision theory 来解释，相同摩尔数的G1和G2在同样反应体系下对同一底物的降解速率应该是相同的，但事实上不一样，两者相差几十倍，这是因为G2缺少了SBD（淀粉结合功能域）。而楼主想要讨论的是吸附和降解是否成正相关，这应该涉及到SBD。SBD对于生淀粉酶来说是重要的，所以我的意见是，Collision theory 是可以解释生淀粉酶降解生淀粉的，但同时应该把SBD考虑进去，还要从结构生物学的角度去思考问题，去丰富降解生淀粉的Collision theory 理论，这与H2+Cl2——2HCl这种没有吸附的反应不同。

对了，差点忘记说了，淀粉酶是一个group，是能降解淀粉的酶的统称，包括很多种酶，里面有3.2.1.1  3.2.1.2  3.2.1.3等等。而生淀粉酶也是一个group，是能降解生淀粉的酶的统称，也包括很多种酶。淀粉这个定义包括生淀粉和非生淀粉，所以淀粉酶包括生淀粉酶。关于我的背景，其实也没什么背景，科研刚入门而已。我现在正在纯化来自一株真菌的淀粉酶，依据已有数据来推断可能是3.2.1.3。有一篇文章在投一个IF1.8的杂志，依据已有数据来推断该酶是3.2.1.3，来自另一株真菌的生淀粉酶，可降解木薯、玉米、大米等几种生淀粉，用于降解生淀粉，与酵母联用于同步糖化发酵产酒精。

[ Last edited by 冼亮淀粉酶 on 2010-10-4 at 14:16 ]
赞一下(2人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
11楼2010-10-04 14:04:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+3):感谢交流~ 2010-10-12 10:22:08
引用回帖:
Originally posted by lwiaanngg at 2010-10-04 16:07:58:
我的意见是你的假设可以值得商榷。“相同摩尔数的G1和G2在同样反应体系下对同一底物的降解速率应该是相同的”。
这个是不一样的。因为你有了SBD，你的SBD对steric factor和collision frequency是有影响，也就是你的G1/G2的steric factor和collision frequency是否相同？毕竟有了SBD， 两者的结构上已经不能在同一个平面上比较。毕竟速率不只是和浓度相关。

“而楼主想要讨论的是吸附和降解是否成正相关” 我认为这是典型的化工问题，解释应该从reaction engineering的角度来看。吸附是一个广的概念，不只在固体中有的。

你提到的你的所做，我不知道你做的东西的目的了。不过，酵母在国外这边，尤其是美国，兴趣已经大大的降低了。毕竟单酒精来说，能量储备还是偏低。而且对于多糖的酶降解，更多的是在cellulose上。毕竟这个的应用前景更广而且成本更低，不过相当难做。有机会可以继续讨论。
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2427046&pid=817181&page=2#pid817181

1、。“相同摩尔数的G1和G2在同样反应体系下对同一底物的降解速率应该是相同的”。
回答：有文献报道结果G1和G2在同样反应体系下对可溶性淀粉的降解速率相似。

2、因为你有了SBD，你的SBD对steric factor和collision frequency是有影响，也就是你的G1/G2的steric factor和collision frequency是否相同？毕竟有了SBD， 两者的结构上已经不能在同一个平面上比较。
回答：你的意思是G1和G2的结构上已经不能在同一个平面上比较，这个可以看它们的结构图，SBD与催化中心折叠后的结构图。而且，如果结构有所改变以至于影响steric factor和collision frequency，那么G1和G2在同样反应体系下对可溶性淀粉的降解速率应该迥异。

3、“而楼主想要讨论的是吸附和降解是否成正相关” 我认为这是典型的化工问题，解释应该从reaction engineering的角度来看。
回答：假如不能吸附也能降解，那么不能依靠SBD的结合位点来结合生淀粉的G2也能以同样的速度来降解生淀粉，但事实上速度多为不同。至于是否应该从反应能的角度来看，或者从这个角度来看会有什么新看法，我觉得我们可以查找一些文献来学习一下，不过楼主这些天去哪里了，抛一个帖子出来让我们两个在闹，自己连个泡泡都不冒，不厚道。

4、你提到的你的所做，我不知道你做的东西的目的了。
回答：用生淀粉来生产酒精可以免去蒸煮这一步，降低能耗，但目前这个工艺大规模应用仍遇到问题，所以生淀粉酶方面的研究还是可以做的。我现在正在纯化的一个淀粉酶可以降解生淀粉，也可以降解非生淀粉，还没纯化出来，基因也还没克隆，所以在这里不好说。

5、酵母在国外这边，尤其是美国，兴趣已经大大的降低了。
回答：我不做酵母，只是做淀粉酶，而这个淀粉酶是想要用来生产酒精，在生产酒精的工艺中需要酵母，我用的酵母为安琪酵母。虽然我们实验室也有好酵母，但还是用被外界所广为接受的酵母有说服力。至于在哪个国家热不热，我觉得还是去国外交流一下更好，可惜我没有被联合培养的福分。

6、毕竟单酒精来说，能量储备还是偏低。
回答：将淀粉和纤维素降解成为葡萄糖之后都可以生产乙醇的，美国已经用玉米淀粉来生产酒精很久了，只是遇到过一些阻力，有人反对用粮食来做酒精。作为一种可再生能源，姑且不论能量储备是否偏低，酒精还是可以作为备选燃料之一的，不论未来怎样，未雨绸缪总是好的。

7、而且对于多糖的酶降解，更多的是在cellulose上。毕竟这个的应用前景更广而且成本更低，不过相当难做。
回答：不是相当难做，是相当相当的难做。不过这个材料也是很受关注的，来源极其广，储备量极其多，这两点比淀粉多多了。但这东西极其难降解，因为植物细胞壁的结构复杂，纤维素的结构也很复杂，具体可以看看丁士友的文章（似乎是中国人，后来留在美国，他儿子已经不会说中文了，跟他儿子说米粉要说noodle的）他在美国做这个，提出了一个纤维素结构的新看法。对于纤维素酶来说，固相反应是限速步骤，预处理很麻烦的，我导师去年去过瑞典大学做过一个月的预处理。应用前景是好，但成本刚好相反，目前不是一般的高。我对纤维素酶的了解不多，只是以第二作者的身份发表了一篇IF2.6的文章。具体就是从水牛瘤胃内容物里拿到了5个比较新的纤维素酶基因，粗略的在E.coli BL21里表达了一下，宏基因组文库在那时候有点热。

8、交流是好的，只是楼主甘心被54？做实验去了。
赞一下(2人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
13楼2010-10-04 19:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by leiyinwill at 2010-10-12 10:05:04:
想请教一下吸附是否是降解的必要前提？

不能吸附也能降解的，这就单纯是靠碰撞了，碰中了就降解，没有SBD的G2也是能降解生淀粉的。只不过挺慢。
赞一下(1人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
16楼2010-10-12 17:22:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2395575楼: Originally posted by zhouqihanshu at 2012-04-26 17:28:00:
你好！请问一下淀粉酶在何种缓冲液中能达到最佳的酶解效果呢？

没有定论的，各人的酶都不同。
赞一下 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
18楼2012-04-26 19:18:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 leiyinwill 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭