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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】淀粉酶吸附
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leiyinwill

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】淀粉酶吸附 已有4人参与

看很多文献上面说淀粉酶对淀粉的降解一般都与淀粉酶和淀粉的吸附呈正相关。然而我最近做的却不是那么回事，现在就在查找这方面的文献。
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好好做实验！
1楼 2010-09-23 16:37:04
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+3):感谢交流~ 2010-10-12 10:22:08
引用回帖:
Originally posted by lwiaanngg at 2010-10-04 16:07:58:
我的意见是你的假设可以值得商榷。“相同摩尔数的G1和G2在同样反应体系下对同一底物的降解速率应该是相同的”。
这个是不一样的。因为你有了SBD，你的SBD对steric factor和collision frequency是有影响，也就是你的G1/G2的steric factor和collision frequency是否相同？毕竟有了SBD， 两者的结构上已经不能在同一个平面上比较。毕竟速率不只是和浓度相关。

“而楼主想要讨论的是吸附和降解是否成正相关” 我认为这是典型的化工问题，解释应该从reaction engineering的角度来看。吸附是一个广的概念，不只在固体中有的。

你提到的你的所做，我不知道你做的东西的目的了。不过，酵母在国外这边，尤其是美国，兴趣已经大大的降低了。毕竟单酒精来说，能量储备还是偏低。而且对于多糖的酶降解，更多的是在cellulose上。毕竟这个的应用前景更广而且成本更低，不过相当难做。有机会可以继续讨论。
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2427046&pid=817181&page=2#pid817181

1、。“相同摩尔数的G1和G2在同样反应体系下对同一底物的降解速率应该是相同的”。
回答：有文献报道结果G1和G2在同样反应体系下对可溶性淀粉的降解速率相似。

2、因为你有了SBD，你的SBD对steric factor和collision frequency是有影响，也就是你的G1/G2的steric factor和collision frequency是否相同？毕竟有了SBD， 两者的结构上已经不能在同一个平面上比较。
回答：你的意思是G1和G2的结构上已经不能在同一个平面上比较，这个可以看它们的结构图，SBD与催化中心折叠后的结构图。而且，如果结构有所改变以至于影响steric factor和collision frequency，那么G1和G2在同样反应体系下对可溶性淀粉的降解速率应该迥异。

3、“而楼主想要讨论的是吸附和降解是否成正相关” 我认为这是典型的化工问题，解释应该从reaction engineering的角度来看。
回答：假如不能吸附也能降解，那么不能依靠SBD的结合位点来结合生淀粉的G2也能以同样的速度来降解生淀粉，但事实上速度多为不同。至于是否应该从反应能的角度来看，或者从这个角度来看会有什么新看法，我觉得我们可以查找一些文献来学习一下，不过楼主这些天去哪里了，抛一个帖子出来让我们两个在闹，自己连个泡泡都不冒，不厚道。

4、你提到的你的所做，我不知道你做的东西的目的了。
回答：用生淀粉来生产酒精可以免去蒸煮这一步，降低能耗，但目前这个工艺大规模应用仍遇到问题，所以生淀粉酶方面的研究还是可以做的。我现在正在纯化的一个淀粉酶可以降解生淀粉，也可以降解非生淀粉，还没纯化出来，基因也还没克隆，所以在这里不好说。

5、酵母在国外这边，尤其是美国，兴趣已经大大的降低了。
回答：我不做酵母，只是做淀粉酶，而这个淀粉酶是想要用来生产酒精，在生产酒精的工艺中需要酵母，我用的酵母为安琪酵母。虽然我们实验室也有好酵母，但还是用被外界所广为接受的酵母有说服力。至于在哪个国家热不热，我觉得还是去国外交流一下更好，可惜我没有被联合培养的福分。

6、毕竟单酒精来说，能量储备还是偏低。
回答：将淀粉和纤维素降解成为葡萄糖之后都可以生产乙醇的，美国已经用玉米淀粉来生产酒精很久了，只是遇到过一些阻力，有人反对用粮食来做酒精。作为一种可再生能源，姑且不论能量储备是否偏低，酒精还是可以作为备选燃料之一的，不论未来怎样，未雨绸缪总是好的。

7、而且对于多糖的酶降解，更多的是在cellulose上。毕竟这个的应用前景更广而且成本更低，不过相当难做。
回答：不是相当难做，是相当相当的难做。不过这个材料也是很受关注的，来源极其广，储备量极其多，这两点比淀粉多多了。但这东西极其难降解，因为植物细胞壁的结构复杂，纤维素的结构也很复杂，具体可以看看丁士友的文章（似乎是中国人，后来留在美国，他儿子已经不会说中文了，跟他儿子说米粉要说noodle的）他在美国做这个，提出了一个纤维素结构的新看法。对于纤维素酶来说，固相反应是限速步骤，预处理很麻烦的，我导师去年去过瑞典大学做过一个月的预处理。应用前景是好，但成本刚好相反，目前不是一般的高。我对纤维素酶的了解不多，只是以第二作者的身份发表了一篇IF2.6的文章。具体就是从水牛瘤胃内容物里拿到了5个比较新的纤维素酶基因，粗略的在E.coli BL21里表达了一下，宏基因组文库在那时候有点热。

8、交流是好的，只是楼主甘心被54？做实验去了。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
13楼2010-10-04 19:45:43
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leiyinwill

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2010-09-23 19:11:49:
生淀粉酶？

就是淀粉酶啊，只是它可以降解生淀粉。
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好好做实验！
3楼2010-09-23 19:25:01
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
淀粉酶对淀粉的降解一般都与淀粉酶和淀粉的吸附呈正相关

只是说一般，没有说你的就是那样，正常
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2010-09-23 22:05:01
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lwiaanngg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
silicare(金币+2):谢谢交流 2010-09-25 08:23:12
这个和吸附无关。应该说是碰撞，也就是酶反应中目前比较通用的collision theory。酶和底物之间的有效碰撞决定于反应效率
Kcoff和你的steric factor, collision frequency, media viscosity,particle size 相关。而且通过stokes-einstein equation, 你还可以得出和particle mobility相关

[ Last edited by lwiaanngg on 2010-9-25 at 00:12 ]
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5楼2010-09-25 00:10:52
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