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superadeel

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】细菌V3区PCR出现问题，引物为357和518，用于DGGE！ 已有5人参与

本人做土壤微生物多样性，在做细菌PCR-DGGE时，细菌V3区PCR条带很不正常，希望哪位大侠能帮帮忙看看。。引物为F357和R518，用mix扩的。
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1楼 2010-09-12 22:09:12
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waldenpond

金虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你这个目的条带对不对？你的marker是多少的啊？
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9楼2012-07-06 17:08:50
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一笑35

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by superadeel at 2010-09-12 22:09:12:
本人做土壤微生物多样性，在做细菌PCR-DGGE时，细菌V3区PCR条带很不正常，希望哪位大侠能帮帮忙看看。。引物为F357和R518，用mix扩的。

感觉还可以啊，就是条带有点宽，可能是你提的DNA不纯导致的。
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努力学习，充实自己！
3楼2010-09-13 08:41:01
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在雨中

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
挺好的.我觉得做细菌的PCR-DGGE.如果没有更高的测序要求,用引物338 518是最好的选择.
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-09-13 18:01:01
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superadeel

新虫 (初入文坛)

我感觉这个PCR有问题，DGGE后测序测不出来

引用回帖:
Originally posted by 在雨中 at 2010-09-13 18:01:01:
挺好的.我觉得做细菌的PCR-DGGE.如果没有更高的测序要求,用引物338 518是最好的选择.

你所说的更高的测序要求是什么，我正是因为DGGE切胶后PCR产物测序测不出来，所以我怀疑这个PCR是不是不好，之前实验室有人做过，能测出来，但是到我这里就不行了，一直没有测出来。   能不能给点建议！！谢谢
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5楼2010-09-13 22:08:45
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