应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】细菌V3区PCR出现问题，引物为357和518，用于DGGE！
51/1返回列表
查看: 2394  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

superadeel

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】细菌V3区PCR出现问题，引物为357和518，用于DGGE！ 已有5人参与

本人做土壤微生物多样性，在做细菌PCR-DGGE时，细菌V3区PCR条带很不正常，希望哪位大侠能帮帮忙看看。。引物为F357和R518，用mix扩的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-09-12 22:09:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superadeel

新虫 (初入文坛)

我感觉这个PCR有问题，DGGE后测序测不出来

引用回帖:
Originally posted by 在雨中 at 2010-09-13 18:01:01:
挺好的.我觉得做细菌的PCR-DGGE.如果没有更高的测序要求,用引物338 518是最好的选择.

你所说的更高的测序要求是什么，我正是因为DGGE切胶后PCR产物测序测不出来，所以我怀疑这个PCR是不是不好，之前实验室有人做过，能测出来，但是到我这里就不行了，一直没有测出来。   能不能给点建议！！谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2010-09-13 22:08:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

一笑35

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by superadeel at 2010-09-12 22:09:12:
本人做土壤微生物多样性，在做细菌PCR-DGGE时，细菌V3区PCR条带很不正常，希望哪位大侠能帮帮忙看看。。引物为F357和R518，用mix扩的。

感觉还可以啊，就是条带有点宽，可能是你提的DNA不纯导致的。
赞一下(1人) 回复此楼
努力学习，充实自己！
3楼2010-09-13 08:41:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
挺好的.我觉得做细菌的PCR-DGGE.如果没有更高的测序要求,用引物338 518是最好的选择.
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-09-13 18:01:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by superadeel at 2010-09-13 22:08:45:


你所说的更高的测序要求是什么，我正是因为DGGE切胶后PCR产物测序测不出来，所以我怀疑这个PCR是不是不好，之前实验室有人做过，能测出来，但是到我这里就不行了，一直没有测出来。   能不能给点建议！！谢谢

V3区的338,518引物做DGGE效果非常好,因为它段,特异性好.但是正是因为短,所以不适合切胶测序.
现在很多人都不太主张使用DGGE切胶测序了.可以使用DGGE看下群落结构演替.但使用长片段DNA克隆测序.这样准确些.
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-09-14 10:40:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 302分求调剂 +4 凡语祈愿 2026-04-08 5/250 2026-04-08 22:03 by 土木硕士招生
[考研] 293分求调剂，外语为俄语 +7 加一一九 2026-04-07 10/500 2026-04-08 20:14 by yutian743
[考研] 362求调剂 +8 我要考大 2026-04-06 12/600 2026-04-08 00:32 by JourneyLucky
[考研] 生物医药调剂｜SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 071000生物学，一志愿深圳大学296分，求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 13/650 2026-04-07 20:34 by lijunpoly
[考研] 085602调剂 初试总分335 +3 19123253302 2026-04-06 3/150 2026-04-07 18:00 by jp9609
[考研] 材料求调剂 +18 一样YWY 2026-04-05 18/900 2026-04-07 15:49 by dxlg
[考研] 334分机械专硕求调剂 +3 蛋花紫菜汤 2026-04-03 3/150 2026-04-07 14:49 by 逍遥cocoa
[考研] 085100建筑学 寻求跨专业调剂 一志愿南大294分 校级省级国家级奖项若干 踏实肯干 +3 1021075758 2026-04-06 4/200 2026-04-07 09:23 by 蓝云思雨
[考研] 22408 331分求调剂 +4 y__1 2026-04-06 4/200 2026-04-06 17:26 by 土木硕士招生
[考研] 308求调剂 +4 maverick^_^ 2026-04-03 4/200 2026-04-05 19:08 by 蓝云思雨
[考研] 301求调剂 +3 XYPLR 2026-04-05 4/200 2026-04-05 19:07 by XYPLR
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:24 by 544594351
[考研] 求 +5 化工专硕323分 2026-04-04 5/250 2026-04-05 08:02 by 544594351
[考研] 344材料与化工调剂 +9 调剂上岸玘 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:10 by happyddm
[考研] 材料与化工306分找调剂 +23 沧海轻舟e 2026-04-02 27/1350 2026-04-04 21:52 by laoshidan
[考研] 316求调剂 +9 墨辰_Orion926 2026-04-04 9/450 2026-04-04 21:35 by lbsjt
[考研] 22408求调剂 354分 可跨专业 +3 hannnnnnn 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:35 by 土木硕士招生
[考研] 293求调剂 +5 末未mm 2026-04-02 6/300 2026-04-03 15:20 by 王保杰33
[考研] 一志愿山东大学，085600，344 +7 魏子per 2026-04-02 8/400 2026-04-02 21:12 by 百灵童888
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭