应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】细菌V3区PCR出现问题，引物为357和518，用于DGGE！
51/1返回列表
查看: 2403  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

superadeel

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】细菌V3区PCR出现问题，引物为357和518，用于DGGE！ 已有5人参与

本人做土壤微生物多样性，在做细菌PCR-DGGE时，细菌V3区PCR条带很不正常，希望哪位大侠能帮帮忙看看。。引物为F357和R518，用mix扩的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-09-12 22:09:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2):鼓励下，欢迎常来~ 2010-09-15 09:43:19
引用回帖:
Originally posted by superadeel at 2010-09-15 09:26:54:
你的意思是用长一点的片段进行DGGE，然后再进行切胶克隆测序，还是说用其他的方法?

较长的PCR片段进行DGGE,也许得到的图谱不太好看,因为PCR片段很难得到完全分离.较短的PCR片段,比如 338,518引物,分离的则比较好,图谱也好看些.
如果非得DGGE切胶测序,那就用长一点的引物吧,碱基信息多一些.
如果重点是得到群落图谱,短引物好,但测序结果很多不确切.
一家之言.
赞一下(3人) 回复此楼
8楼2010-09-15 09:34:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

一笑35

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by superadeel at 2010-09-12 22:09:12:
本人做土壤微生物多样性，在做细菌PCR-DGGE时，细菌V3区PCR条带很不正常，希望哪位大侠能帮帮忙看看。。引物为F357和R518，用mix扩的。

感觉还可以啊，就是条带有点宽，可能是你提的DNA不纯导致的。
赞一下(1人) 回复此楼
努力学习，充实自己！
3楼2010-09-13 08:41:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
挺好的.我觉得做细菌的PCR-DGGE.如果没有更高的测序要求,用引物338 518是最好的选择.
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-09-13 18:01:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superadeel

新虫 (初入文坛)

我感觉这个PCR有问题，DGGE后测序测不出来

引用回帖:
Originally posted by 在雨中 at 2010-09-13 18:01:01:
挺好的.我觉得做细菌的PCR-DGGE.如果没有更高的测序要求,用引物338 518是最好的选择.

你所说的更高的测序要求是什么，我正是因为DGGE切胶后PCR产物测序测不出来，所以我怀疑这个PCR是不是不好，之前实验室有人做过，能测出来，但是到我这里就不行了，一直没有测出来。   能不能给点建议！！谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2010-09-13 22:08:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 +4 hzhahg 2026-04-06 4/200 2026-04-08 16:20 by luoyongfeng
[考研] 求材料调剂，一志愿郑州大学289分 +21 硕星赴 2026-04-03 21/1050 2026-04-08 11:55 by 猪会飞
[考研] 336求调剂，一志愿中科大 +9 墨彧 yuyu 2026-04-06 9/450 2026-04-08 11:24 by 想读书的菌菌
[考研] 297求调剂 +16 GENJIOW 2026-04-07 17/850 2026-04-08 11:05 by 逆水乘风
[考研] 调剂 +3 电气300求调剂不 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:39 by 电气300求调剂不
[考研] 生物医药调剂｜SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 304求调剂（085602，过四级，一志愿985） +25 化工人999 2026-04-04 26/1300 2026-04-07 22:06 by hemengdong
[考研] 求调剂 +4 电气小神童 2026-04-04 6/300 2026-04-07 00:14 by guanxin1001
[考研] 材料专硕322 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-05 11/550 2026-04-06 14:07 by lqwchd
[考研] 求调剂，一志愿郑州大学材料与化工专硕，英二数二342分，求老师收留 +19 v12abo 2026-04-02 21/1050 2026-04-06 09:29 by 蓝云思雨
[考研] 377求调剂 +6 by.ovo 2026-04-05 6/300 2026-04-05 22:18 by dongzh2009
[考研] 材料调剂 +6 一样YWY 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:30 by 南航~万老师
[考研] 327求调剂 +4 拾光任染 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:16 by 南航~万老师
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +13 洛神哥哥 2026-04-03 13/650 2026-04-05 17:27 by zzx2138
[考研] 男生，一志愿沪9生物学071000，初试308求调剂 +3 刘墨墨 2026-04-04 3/150 2026-04-05 08:26 by barlinike
[考研] 286求调剂 +3 草木不言 2026-04-04 3/150 2026-04-04 22:40 by lbsjt
[考研] 278求调剂 +3 依旧！ 2026-04-02 4/200 2026-04-04 20:27 by 蓝云思雨
[考研] 387求调剂 +4 爱吃片豆土 2026-04-03 5/250 2026-04-04 08:10 by 岸上的一条鱼
[考研] 本科985，专业0812分336求调剂 +4 莫莫很行 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:31 by zhq0425
[考研] 兽医调剂 +3 wh119216 2026-04-02 3/150 2026-04-03 19:34 by zrongyan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭