24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2397  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

superadeel

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】细菌V3区PCR出现问题,引物为357和518,用于DGGE! 已有5人参与

本人做土壤微生物多样性,在做细菌PCR-DGGE时,细菌V3区PCR条带很不正常,希望哪位大侠能帮帮忙看看。。引物为F357和R518,用mix扩的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superadeel

新虫 (初入文坛)

你的意思是用长一点的片段进行DGGE,然后再进行切胶克隆测序,还是说用其他的方法?
引用回帖:
Originally posted by 在雨中 at 2010-09-14 10:40:52:


V3区的338,518引物做DGGE效果非常好,因为它段,特异性好.但是正是因为短,所以不适合切胶测序.
现在很多人都不太主张使用DGGE切胶测序了.可以使用DGGE看下群落结构演替.但使用长片段DNA克隆测序.这样准确些.

7楼2010-09-15 09:26:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

一笑35

铁虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by superadeel at 2010-09-12 22:09:12:
本人做土壤微生物多样性,在做细菌PCR-DGGE时,细菌V3区PCR条带很不正常,希望哪位大侠能帮帮忙看看。。引物为F357和R518,用mix扩的。

感觉还可以啊,就是条带有点宽,可能是你提的DNA不纯导致的。
努力学习,充实自己!
3楼2010-09-13 08:41:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
挺好的.我觉得做细菌的PCR-DGGE.如果没有更高的测序要求,用引物338 518是最好的选择.
4楼2010-09-13 18:01:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superadeel

新虫 (初入文坛)

我感觉这个PCR有问题,DGGE后测序测不出来

引用回帖:
Originally posted by 在雨中 at 2010-09-13 18:01:01:
挺好的.我觉得做细菌的PCR-DGGE.如果没有更高的测序要求,用引物338 518是最好的选择.

你所说的更高的测序要求是什么,我正是因为DGGE切胶后PCR产物测序测不出来,所以我怀疑这个PCR是不是不好,之前实验室有人做过,能测出来,但是到我这里就不行了,一直没有测出来。   能不能给点建议!!谢谢
5楼2010-09-13 22:08:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 318求调剂 +13 ykyhsa 2026-04-05 15/750 2026-04-08 21:37 by wj165256
[考研] 269求调剂 +6 啊啊我我 2026-04-07 6/300 2026-04-08 20:04 by 我减肥1
[考研] 求调剂 +14 张zic 2026-04-05 15/750 2026-04-08 16:14 by 一只好果子?
[考研] 化工学硕 285求调剂 +26 Wisjxn 2026-04-07 26/1300 2026-04-08 14:42 by screening
[考研] 电子信息346 +4 zuoshaodian 2026-04-08 4/200 2026-04-08 11:54 by zzucheup
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 259求调剂 +5 就爱吃土豆呀呀 2026-04-07 5/250 2026-04-07 22:40 by JourneyLucky
[考研] 326求调剂 +5 9ahye 2026-04-02 6/300 2026-04-07 21:37 by lijunpoly
[考研] 336材料与化工085600求调剂 +19 水星记infp 2026-04-05 22/1100 2026-04-07 21:11 by yongzhesheng
[考研] 生物工程求调剂 +13 喜欢还是不甘心 2026-04-05 13/650 2026-04-07 16:55 by Ecowxq666!
[考研] 305分求调剂 +3 哈_哈_哈_哈_哈 2026-04-04 5/250 2026-04-07 14:49 by 哈_哈_哈_哈_哈
[考研] 学硕化学工程与技术,一志愿中国海洋大学320+求调剂 +9 披星河 2026-04-02 9/450 2026-04-07 12:53 by 尽舜尧1
[考研] 调剂 +4 mcbbc 2026-04-06 5/250 2026-04-07 12:33 by upczlm1989
[考研] 085100建筑学 寻求跨专业调剂 一志愿南大294分 校级省级国家级奖项若干 踏实肯干 +3 1021075758 2026-04-06 4/200 2026-04-07 09:23 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿211生物学280分 求调剂 +5 李rien 2026-04-05 5/250 2026-04-06 10:30 by zhyzzh
[考研] 085600,320分求调剂 +16 大馋小子 2026-04-04 17/850 2026-04-06 07:58 by MOF_Catal
[考研] 341求调剂 +3 洛多罗 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:36 by 智能智慧
[考研] 一志愿华北电力大学(北京),材料科学与工程学硕265,求调剂 +11 yelck 2026-04-03 12/600 2026-04-04 19:52 by dongzh2009
[考研] 321求调剂 +6 认真求上学 2026-04-03 6/300 2026-04-04 19:51 by dongzh2009
[考研] 268求调剂 +8 你好tg 2026-04-03 9/450 2026-04-04 05:08 by gswylq
信息提示
请填处理意见