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feiye2214

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】粘性末端连接问题 已有4人参与

小弟在做一个连接,质粒大小4.2kb,目的片段1.6kb
质粒中有EcoR I和BamH I酶切位点,1.6kb的PCR片段两端也被设计了这两个酶切位点
我的流程是:把质粒从菌中提出来,PCR片段是扩增得到;然后用两种限制性酶酶切这两个片段,得到具有粘性末端的4.2kb和1.6kb的片段;一定量跑胶之后,割胶提纯目的片段;提纯液用于连接反应

全程都是采用试剂盒

我想问的是:跑胶之后提纯,是不是会损伤DNA啊?尤其是粘性末端!
能不能在酶切之后就连接反应,不要经过提纯这一步(跑胶显示条带单一,没有杂带),那里面的限制性酶会不会影响连接啊?
求高手指点
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zzp55zzp

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
应该是胶回收的问题。
你酶切之后应该用PCR回收的方法纯化了连接
使用胶回收试剂盒的话,引物融化胶的试剂PH很高,加上温度影响,很容易把粘性末端破坏掉,所谓粘性末端不过是很短的,只有几个碱基的单链而已。
10楼2010-08-09 11:09:07
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墨香若水

木虫 (著名写手)

小小囧虫


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
双酶切后还是要纯化的。不懂你为什么割胶纯化,直接纯化就好了,当做PCR产物一样。
仕不可不弘毅,任重而道远
2楼2010-08-08 16:41:28
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feiye2214

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 墨香若水 at 2010-08-08 16:41:28:
双酶切后还是要纯化的。不懂你为什么割胶纯化,直接纯化就好了,当做PCR产物一样。

怎么直接纯化,之前没有做过,多谢赐教啊?
3楼2010-08-08 16:45:20
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墨香若水

木虫 (著名写手)

小小囧虫

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+4):鼓励热心的虫子。 2010-08-08 18:38:54
引用回帖:
Originally posted by feiye2214 at 2010-08-08 16:45:20:

怎么直接纯化,之前没有做过,多谢赐教啊?

你的pcr产物平时怎么纯化的,应该是用PCR产物纯化试剂盒吧,就用这个试剂盒纯化~
仕不可不弘毅,任重而道远
4楼2010-08-08 16:47:32
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