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sdluqun

铁杆木虫 (著名写手)

板砖队长

[交流] 【求助/交流】求助TA克隆问题 已有9人参与

前天做的目的片段PCR并且胶回收,经琼脂糖检测,4微升上样量,条带亮度大约D2000 Marker 中的750条带的两倍,即含量约为300ng/ul。当天晚上做上连接,用的是promega的T载体:5ul  2*buffer;   1ul T4连接酶;    1ul(50ng/ul) pGEM-T easy 载体;    3/2/1ul 回收的目的片段;   ddH2O补齐至10ul体系。
前天晚上接菌DH5α,昨天早上转接,之后氯化钙法制备了感受态,放置4小时,转化,摇菌,涂板。平板翻过来的时间为20:30,今天早上来实验室看看,阳性对照和样品都是一片空白,郁闷,
恳求高手指点!!!
PS:我的目的基因在1400bp左右,是不是片段偏大不好连呢?

[ Last edited by sdluqun on 2010-6-10 at 19:44 ]
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尔非我焉知我悲喜
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主

sdluqun(金币+2):谢谢您的宝贵意见! 2010-06-09 11:22:46
感受态失败,先解决了这个问题才能继续说别的,用定量的环形质粒检测一下,1ug质粒至少要达到6次方的转化效率才可以勉强应付T载体
2楼2010-06-09 11:19:46
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liyong1981

金虫 (正式写手)


competent cell 效率不高吧~
3楼2010-06-09 11:42:12
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ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
amisking(金币+3):好建议! 2010-06-09 12:30:31
新制备的感受态用之前一定要检验
一是不转东西直接涂抗性板,看看有没有污染
二是转定量的超螺旋质粒,计算转化效率。一般氯化钙做的感受态在(10^6~10^7 )cfu/ug DNA 比较正常,太低的话转连接产物很容易得不到阳性克隆

要求高的话可以用一些改进的制备液(MnCl2,KCl,CaCl2等盐组成),做得好的话能到10^8

[ Last edited by ben1147 on 2010-6-9 at 13:13 ]
4楼2010-06-09 11:50:27
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fywjp

木虫 (正式写手)


amisking(金币+1):建议不错! 2010-06-09 12:30:44
楼上说的都有可能,建议楼主每一步都做个对照,查找原因,克隆本身步骤就多,不做对照出了问题不好说啊,弄不清请哪个环节出问题的。
5楼2010-06-09 12:05:10
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墨香若水

木虫 (著名写手)

小小囧虫

sdluqun(金币+2):我用的是普通的Taq,没用高保真酶,应该会有A尾巴吧?还是要谢谢您的建议 2010-06-09 14:49:10
感受态要先验证。    楼主扩增片段是用pfu吧,没加polyA?
仕不可不弘毅,任重而道远
6楼2010-06-09 12:25:21
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悬崖上的牛仔

铜虫 (小有名气)

sdluqun(金币+1): 2010-06-09 14:49:23
sdluqun(金币+1): 2010-06-09 14:49:32
加的目的片段的量可以再改进一下
生如夏花
7楼2010-06-09 12:59:10
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bujunyang

木虫 (正式写手)

卓尔不群

sdluqun(金币+1):以为之前做的还好,问了下周围实验室都自己做的说效率还蛮高,所以就没买... 2010-06-09 14:50:20
我认为实验室就不应该在做感受态细胞这种事情上浪费时间。
来是偶然,去是必然。
8楼2010-06-09 13:05:12
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ben1147

木虫 (正式写手)


lstt09nk(金币+1):确实如此~~ 2010-06-09 16:05:41
sdluqun(金币+1): 2010-06-09 16:43:42
引用回帖:
Originally posted by bujunyang at 2010-06-09 13:05:12:
我认为实验室就不应该在做感受态细胞这种事情上浪费时间。

问题是不是所有的菌株都是商业化的
常见的工程菌买感受态可以,一些特殊用途的菌,或是自己实验室构建的菌还得自己做
9楼2010-06-09 15:53:43
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zhangjh069975

银虫 (初入文坛)

sdluqun(金币+1): 2010-06-09 23:01:25
感受态的问题
心若在,梦就在!
10楼2010-06-09 19:35:15
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