24小时热门版块排行榜    

查看: 1993  |  回复: 22

wwsw38

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助!大家帮我看一下我的PCR体系有什么问题没? 已有16人参与

我最近在做一种未知菌的16SRDNA的PCR,一直没做出来,大家帮我看一下到底是哪里出现了问题?
        
              PCR体系:
               模板  5uL
               上游引物(2.5uM)  5uL        Tm 57.8
               下游引物(2.5uM)  5uL        Tm61.9              
               Mgcl2(50mM)       3 uL     
               10*PCR  buffer     5uL  
                dNTP (2.5mM )    1uL
               Taq酶(2u/ul)        1uL
               ddH2O                 25uL      

           反应程序:
                        95(5m)
                       
                        95(1m)
                        53(1m)
                        73(2m)

                        72(10m)

                   30个循环.
结果P不出来,并且我也不知道P出来的条带应该是多少bp?大家帮我分析分析吧,只有10个金币全送上.

他们给我的引物合成书上的TM值是:
               上游引物      Tm 57.8
               下游引物     Tm61.9

但是我根据TM=4(G+C)+2(A+T)引物长都为20BP,算出来的
               上游引物      Tm 60
               下游引物     Tm64
所以我的程序退火温度应该是多少呢?53会不会太低了?

[ Last edited by wwsw38 on 2010-4-23 at 21:56 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

为自己加油
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwsw38

铁虫 (小有名气)

怎么没人帮我看看啊,我在在线等啊
为自己加油
2楼2010-04-23 15:00:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bihaiqingt

金虫 (小有名气)

wwsw38(金币+1):我试试看 2010-04-23 21:36
退火温度为什么用53?太低了吧?调到60度试试吧
3楼2010-04-23 15:54:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bihaiqingt

金虫 (小有名气)

30循环应该只是第二阶段
4楼2010-04-23 15:56:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hyde0706

木虫 (正式写手)

你的模板质量如何?引物设计有没有问题?这两个才是PCR最关键的因素。可以尝试将循环数增加一些。
5楼2010-04-23 15:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dfl204

铁杆木虫 (著名写手)

体系中模板量一般不用体积来衡量。10-100ng质粒就够了,如果是gDNA可以多一些。

扩增不出来,首先要考虑模板是否降解,这个可以用其它引物来验证;
试着把MgCl2降一些,设计几个浓度梯度。
6楼2010-04-23 16:00:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)


同意楼上的,引物和模板最关键,引物设计的好,温度跨度很大也能P出来
7楼2010-04-23 16:01:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)

wwsw38(金币+1):我觉得可能最有可能的是提的DNA不质量不好,谢谢你 2010-04-23 19:15
引物也有点少,5-8ul就应该够了
dNTP肯定少了,4ul
Mg离子,3-4ul

总的来说你这个体系就dNTP有问题,看一下酶的说明书
扩不出来有可能是引物的问题,不过你至少应该做个温度梯度

你不知道产物多大,太奇怪了,谁给你的引物,怎么设计的
8楼2010-04-23 16:02:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwsw38

铁虫 (小有名气)

哦,我这个引物我刚查了一下扩出来应该是1500BP,引物应该没问题.我就是想看看体系和反应程序有没有什么问题
为自己加油
9楼2010-04-23 16:17:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

哪家公司的酶?
10楼2010-04-23 16:32:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wwsw38 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 323求调剂 +6 洼小桶 2026-03-18 6/300 2026-03-23 00:29 by king123!
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +6 生物工程调剂 2026-03-17 10/500 2026-03-22 20:22 by edmund7
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-20 3/150 2026-03-22 16:00 by ColorlessPI
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 318求调剂 +4 plum李子 2026-03-21 7/350 2026-03-22 14:17 by ColorlessPI
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 4/200 2026-03-22 10:25 by QGZDSYS
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +5 shxchem 2026-03-20 7/350 2026-03-21 17:09 by ColorlessPI
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 332求调剂 +4 ydfyh 2026-03-17 4/200 2026-03-21 02:20 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 322求调剂 +4 然11 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:12 by luoyongfeng
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见