24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 2036  |  回复: 22

wwsw38

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助!大家帮我看一下我的PCR体系有什么问题没? 已有16人参与

我最近在做一种未知菌的16SRDNA的PCR,一直没做出来,大家帮我看一下到底是哪里出现了问题?
        
              PCR体系:
               模板  5uL
               上游引物(2.5uM)  5uL        Tm 57.8
               下游引物(2.5uM)  5uL        Tm61.9              
               Mgcl2(50mM)       3 uL     
               10*PCR  buffer     5uL  
                dNTP (2.5mM )    1uL
               Taq酶(2u/ul)        1uL
               ddH2O                 25uL      

           反应程序:
                        95(5m)
                       
                        95(1m)
                        53(1m)
                        73(2m)

                        72(10m)

                   30个循环.
结果P不出来,并且我也不知道P出来的条带应该是多少bp?大家帮我分析分析吧,只有10个金币全送上.

他们给我的引物合成书上的TM值是:
               上游引物      Tm 57.8
               下游引物     Tm61.9

但是我根据TM=4(G+C)+2(A+T)引物长都为20BP,算出来的
               上游引物      Tm 60
               下游引物     Tm64
所以我的程序退火温度应该是多少呢?53会不会太低了?

[ Last edited by wwsw38 on 2010-4-23 at 21:56 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

为自己加油
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwsw38

铁虫 (小有名气)

怎么没人帮我看看啊,我在在线等啊
为自己加油
2楼2010-04-23 15:00:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bihaiqingt

金虫 (小有名气)

wwsw38(金币+1):我试试看 2010-04-23 21:36
退火温度为什么用53?太低了吧?调到60度试试吧
3楼2010-04-23 15:54:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bihaiqingt

金虫 (小有名气)

30循环应该只是第二阶段
4楼2010-04-23 15:56:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hyde0706

木虫 (正式写手)

你的模板质量如何?引物设计有没有问题?这两个才是PCR最关键的因素。可以尝试将循环数增加一些。
5楼2010-04-23 15:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dfl204

铁杆木虫 (著名写手)

体系中模板量一般不用体积来衡量。10-100ng质粒就够了,如果是gDNA可以多一些。

扩增不出来,首先要考虑模板是否降解,这个可以用其它引物来验证;
试着把MgCl2降一些,设计几个浓度梯度。
6楼2010-04-23 16:00:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)


同意楼上的,引物和模板最关键,引物设计的好,温度跨度很大也能P出来
7楼2010-04-23 16:01:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)

wwsw38(金币+1):我觉得可能最有可能的是提的DNA不质量不好,谢谢你 2010-04-23 19:15
引物也有点少,5-8ul就应该够了
dNTP肯定少了,4ul
Mg离子,3-4ul

总的来说你这个体系就dNTP有问题,看一下酶的说明书
扩不出来有可能是引物的问题,不过你至少应该做个温度梯度

你不知道产物多大,太奇怪了,谁给你的引物,怎么设计的
8楼2010-04-23 16:02:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwsw38

铁虫 (小有名气)

哦,我这个引物我刚查了一下扩出来应该是1500BP,引物应该没问题.我就是想看看体系和反应程序有没有什么问题
为自己加油
9楼2010-04-23 16:17:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

哪家公司的酶?
10楼2010-04-23 16:32:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wwsw38 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专业344求调剂 +17 hualkop 2026-04-10 22/1100 2026-04-14 16:21 by sxdj2
[考研] 各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。 +11 路六六jjj 2026-04-13 11/550 2026-04-14 16:01 by zs92450
[考研] 药学求调剂 +6 RussHu 2026-04-12 7/350 2026-04-14 15:16 by sxdj2
[考研] 考研求调剂 +6 ban班小七 2026-04-11 6/300 2026-04-14 14:06 by 哆啦A梦只是个梦
[考研] 机械工程313分找工科调剂 +4 双一流本科机械 2026-04-08 4/200 2026-04-14 07:32 by Abskk
[考研] 材料考研调剂 +29 云木达达 2026-04-11 31/1550 2026-04-13 13:32 by lyh鲁老师
[考研] 344 材料专业 求调剂211 无地域要求 +8 hualkop 2026-04-11 8/400 2026-04-12 22:24 by fqwang
[考研] 求调剂 +16 张番茄不炒蛋 2026-04-10 17/850 2026-04-12 13:58 by 熬夜成!
[考研] 电气专硕320求调剂 +6 小麻子111 2026-04-10 6/300 2026-04-12 10:54 by lemon6009
[考研] 材料工程日语考生求调剂 +7 0856?调剂 2026-04-10 7/350 2026-04-11 21:33 by 蓝云思雨
[考研] 086003调剂求助 +21 苏弋万 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 20:25 by dongdian1
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 一志愿北理工298英一数二已上岸,感谢各位老师 +14 Reframe 2026-04-10 16/800 2026-04-10 23:07 by caotw2020
[考研] 计算机类求调剂,22408-274分 +7 上岸de小虫 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:56 by fxue1114
[考研] 青岛科技大学材料学院,环境学院调剂补录4月10日以前都可以 +3 1青科大。 2026-04-09 5/250 2026-04-10 09:58 by 翩翩一书生
[考研] 本科西工大 0856 324求调剂 +10 wysyjs25 2026-04-09 11/550 2026-04-10 08:37 by 5268321
[考研] 初试分332,一志愿报考西北工业大学, +11 故人?? 2026-04-09 11/550 2026-04-09 21:54 by JineShine
[考研] 调剂 +19 2261744733 2026-04-08 19/950 2026-04-09 19:11 by vgtyfty
[考研] 材料307分求大佬组收留 +17 Hll胡 2026-04-07 17/850 2026-04-09 10:53 by liuhuiying09
[考研] 22408 266求调剂 +11 masss11222 2026-04-07 14/700 2026-04-08 11:06 by yulian1987
信息提示
请填处理意见