24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 2038  |  回复: 22

wwsw38

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助!大家帮我看一下我的PCR体系有什么问题没? 已有16人参与

我最近在做一种未知菌的16SRDNA的PCR,一直没做出来,大家帮我看一下到底是哪里出现了问题?
        
              PCR体系:
               模板  5uL
               上游引物(2.5uM)  5uL        Tm 57.8
               下游引物(2.5uM)  5uL        Tm61.9              
               Mgcl2(50mM)       3 uL     
               10*PCR  buffer     5uL  
                dNTP (2.5mM )    1uL
               Taq酶(2u/ul)        1uL
               ddH2O                 25uL      

           反应程序:
                        95(5m)
                       
                        95(1m)
                        53(1m)
                        73(2m)

                        72(10m)

                   30个循环.
结果P不出来,并且我也不知道P出来的条带应该是多少bp?大家帮我分析分析吧,只有10个金币全送上.

他们给我的引物合成书上的TM值是:
               上游引物      Tm 57.8
               下游引物     Tm61.9

但是我根据TM=4(G+C)+2(A+T)引物长都为20BP,算出来的
               上游引物      Tm 60
               下游引物     Tm64
所以我的程序退火温度应该是多少呢?53会不会太低了?

[ Last edited by wwsw38 on 2010-4-23 at 21:56 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

为自己加油
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwsw38

铁虫 (小有名气)

怎么没人帮我看看啊,我在在线等啊
为自己加油
2楼2010-04-23 15:00:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bihaiqingt

金虫 (小有名气)

wwsw38(金币+1):我试试看 2010-04-23 21:36
退火温度为什么用53?太低了吧?调到60度试试吧
3楼2010-04-23 15:54:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bihaiqingt

金虫 (小有名气)

30循环应该只是第二阶段
4楼2010-04-23 15:56:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hyde0706

木虫 (正式写手)

你的模板质量如何?引物设计有没有问题?这两个才是PCR最关键的因素。可以尝试将循环数增加一些。
5楼2010-04-23 15:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dfl204

铁杆木虫 (著名写手)

体系中模板量一般不用体积来衡量。10-100ng质粒就够了,如果是gDNA可以多一些。

扩增不出来,首先要考虑模板是否降解,这个可以用其它引物来验证;
试着把MgCl2降一些,设计几个浓度梯度。
6楼2010-04-23 16:00:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)


同意楼上的,引物和模板最关键,引物设计的好,温度跨度很大也能P出来
7楼2010-04-23 16:01:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)

wwsw38(金币+1):我觉得可能最有可能的是提的DNA不质量不好,谢谢你 2010-04-23 19:15
引物也有点少,5-8ul就应该够了
dNTP肯定少了,4ul
Mg离子,3-4ul

总的来说你这个体系就dNTP有问题,看一下酶的说明书
扩不出来有可能是引物的问题,不过你至少应该做个温度梯度

你不知道产物多大,太奇怪了,谁给你的引物,怎么设计的
8楼2010-04-23 16:02:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwsw38

铁虫 (小有名气)

哦,我这个引物我刚查了一下扩出来应该是1500BP,引物应该没问题.我就是想看看体系和反应程序有没有什么问题
为自己加油
9楼2010-04-23 16:17:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

哪家公司的酶?
10楼2010-04-23 16:32:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wwsw38 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 通信工程求调剂!!! +4 zlb770521 2026-04-14 4/200 2026-04-14 18:19 by lbsjt
[考研] 材料299专硕求调剂 +16 +21 2026-04-09 16/800 2026-04-14 17:06 by jiangguiquan11
[考研] 297工科调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-13 13/650 2026-04-14 16:46 by Art1977
[考研] 求调剂 +20 MAX怅惘 2026-04-09 22/1100 2026-04-14 14:57 by 独醉梦孤城
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
[考研] 人工智能320调剂08工类还有机会吗 +18 振—TZ 2026-04-10 19/950 2026-04-14 10:34 by screening
[考研] 305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-11 8/400 2026-04-14 09:04 by pengliang8036
[考研] 求调剂,985材料与化工348分 +9 涵竹刘 2026-04-11 14/700 2026-04-13 22:26 by 涵竹刘
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 一志愿华工085600 331分 +7 天下ww 2026-04-09 7/350 2026-04-13 09:01 by lhj2009
[教师之家] 山东双非院校考核超级无底线,领导幸灾乐祸,教师遭殃恐 +3 qut2026 2026-04-11 7/350 2026-04-12 20:24 by qut2026
[考研] 求调剂,262机械专硕 +8 嗯yyl 2026-04-08 8/400 2026-04-12 02:31 by 秋豆菜芽
[考研] 343求调剂 +9 王国帅 2026-04-10 9/450 2026-04-11 20:31 by dongdian1
[考研] 0859,337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 11:34 by caotw2020
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +11 LZH(等待调剂中 2026-04-10 11/550 2026-04-11 08:39 by zhq0425
[考研] 085506-求调剂-285分 +3 雷欧飞踢 2026-04-08 3/150 2026-04-11 08:37 by zhq0425
[考研] 284求调剂 +9 让我上岸吧阿西 2026-04-09 11/550 2026-04-10 19:18 by 靖jing
[考研] 0858求调剂 5+5 Gky09300550, 2026-04-10 8/400 2026-04-10 19:13 by chemisry
[考研] 一志愿矿大,材料工程专硕314分,0856可调都可以 +15 无懈可击的巨人 2026-04-09 15/750 2026-04-10 18:10 by hmn_wj
[考研] 青岛科技大学材料学院,环境学院调剂补录4月10日以前都可以 +3 1青科大。 2026-04-09 5/250 2026-04-10 09:58 by 翩翩一书生
信息提示
请填处理意见