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labglion
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求助:PCR扩增不出条带
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本人新手,最近在扩增RNA病毒中的两段基因分别为VP1和3D,提取的RNA用通用引物反转录得到cDNA,用检测引物可以看出条带很亮,但用扩增基因全长的引物就扩不出来了,反转录引物是用的Oligo dT,也尝试过自己设计的下游引物,PCR引物试了好多,酶也换过几种,退火温度梯度做过50-60度的,DMSO也试过,本来觉得很简单的一点实验一直卡在这不动了,自己都快没有信心了。求大神们不吝赐教。
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2017-02-28 17:31:26
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xinxiyuzhou
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试试在前后各设计一对引物看是否可以扩出来。
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2017-03-04 16:44:44
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自己顶顶,没有大神来帮忙么? 想问一下除了引物问题,会不会有可能是RNA在提取过程断裂了呢?检测引物扩增片段长度为358bp,而我想扩增的两段基因长度分别为762bp和1407bp,有没有这个可能呢?
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2017-03-04 15:51:48
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检测引物是什么鬼?这么短的片段应该很容易扩出来的,是在做不出来可以用融合PCR,找找相关的文献,直接拿别人的条件应该可以做的出来
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2017-03-04 16:15:37
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xinxiyuzhou
at 2017-03-04 16:15:37
检测引物是什么鬼?这么短的片段应该很容易扩出来的,是在做不出来可以用融合PCR,找找相关的文献,直接拿别人的条件应该可以做的出来
检测引物是我在拿到病料之后用来检测是否含有这种病毒的引物。相关文献找过,用了不少别人的引物也是扩不出来。
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4楼
2017-03-04 16:41:58
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不知道楼主问题解决没?我也遇到相同的情况,前中后三个位置分别设计了引物,中间一段跨越内含子,片段200bp左右,都可以p的出来,但是全长就是p不出来,现在正在从基因组上进行两段pcr,之后连接~
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6楼
2017-03-09 08:56:11
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xinxiyuzhou
at 2017-03-04 16:44:44
试试在前后各设计一对引物看是否可以扩出来。
这几天尝试过你说的这种方法,还是没有扩增出来。我怀疑不是引物的问题,因为真的已经尝试过了对很多引物了,有自己设计的,也有文献上的。这么多引物,总该有合适的吧?
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7楼
2017-03-09 15:43:44
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6楼
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小冀-
at 2017-03-09 08:56:11
不知道楼主问题解决没?我也遇到相同的情况,前中后三个位置分别设计了引物,中间一段跨越内含子,片段200bp左右,都可以p的出来,但是全长就是p不出来,现在正在从基因组上进行两段pcr,之后连接~
问题还没有解决,依旧是扩不出来。我做的是病毒,按说应该更简单一些,快失去信心了
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8楼
2017-03-09 15:45:11
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labglion
at 2017-03-09 15:45:11
问题还没有解决,依旧是扩不出来。我做的是病毒,按说应该更简单一些,快失去信心了...
彼此彼此,一起加油吧,祝好
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9楼
2017-03-09 16:03:56
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您好,有考虑过专业的生物公司提供帮助吗,我这边希望能帮到您!
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2017-03-09 17:25:40
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