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angjzy

木虫 (小有名气)

[求助] 做cDNA的PCR扩增没有结果呀!

做了一个cDNA,用这段基因扩增actin做阳性对照,能扩增出正确片段。
说明体系、模板都没问题。

用目的基因特异引物扩增,怎么也扩不出来。
这个引物以前有师兄用过,能正确扩出目的片段。
说明引物序列没问题。

但现在我做怎么也做不出来。
怀疑引物不好用了,
就用了new aliquote 引物,还是扩不出来。

求助大虾们,这是怎么个情况呀,怎么能把它弄出来呢?

博士刚开始,就遇到这种问题,崩溃ing~~~

[ Last edited by angjzy on 2011-10-11 at 04:33 ]
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红多多

木虫 (正式写手)

版筑饭牛的日子

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): 鼓励应助! 2011-10-11 09:25:41
angjzy(金币+3): 太谢谢了,我试试。希望大家都顺利哈 2011-10-12 01:46:27
呵呵 分子方面的实验就是这个样子的 总有些说不清道不明的原因
楼主这种原因我以前也经常遇到,有时候重复做几次PCR就能出来,有时候就是死命都没结果。
我的建议就是
1.先重复几次实验,有时候会由于一些比较低级的问题,比如忘加某组分,或者忘记离心,或者其他由于误差等等原因产生,会出不来结果,有时候同样的东西,做两个重复也会一个出一个不出,我把这个归结为人品不好,暴率比较低的缘故。
2.要弄清楚你扩增片段所处整个mRNA的位置,说简单点,你的ACTIN能扩出来不代表你的片段能扩增出来,特别是你如果扩增基因全长的时候,因为ACTION往往丰度高,即使有部分RNA降解也很可能有全长。另外即使没有全长ACTIN,你设计的引物如果不再整个序列的前端,这个也是说明不了模版质量的,总之actin的设计,一定要设计在序列比较靠末端的位置,用actin检测模版质量,至少需要稀释100倍检测。这个是我们实验室的玩法,非常有效.所以,你应该考虑重新提取RNA或者重新反转录试试结果。

一点个人看法,希望对你有用,祝实验成功
可以用QQ找我……
2楼2011-10-11 09:09:25
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