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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 测序结果问题！
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804371539

铜虫 (小有名气)

[求助] 测序结果问题！ 已有3人参与

实验新手，求指导。送去公司测序了基因的3‘5’。3‘ 5’各送去两份，每个正反测序。用contig express进行拼接，请问我用哪个测序结果拼接呢？
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1楼 2016-04-29 09:48:14
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

i760912798

木虫 (正式写手)
公司一般都负责序列拼接的

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4楼2016-04-29 17:31:43
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 804371539 at 2016-04-29 18:37:49
blast之后和目的基因的相似度
...

不仅仅看相似性，还要看突变位点突变类型，要看是有意义突变还是无意义突变。
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9楼2016-04-29 19:35:54
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匿名

用户注销 (正式写手)
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16楼2016-05-03 10:48:26
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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804371539: 金币+4, ★★★很有帮助 2016-05-03 22:33:06
没用过这个软件，可以用DNAMA拼接，不用考虑正反向问题，输入测序结果就能拼。
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2楼2016-04-29 15:21:58
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804371539

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2016-04-29 15:21:58
没用过这个软件，可以用DNAMA拼接，不用考虑正反向问题，输入测序结果就能拼。

我拼接了一下   有两个结果，是不是blast哪个好用哪个啊
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3楼2016-04-29 17:10:59
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
不知道你说的好的标准是什么？
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5楼2016-04-29 17:33:10
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804371539

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by stone2239 at 2016-04-29 17:33:10
不知道你说的好的标准是什么？

blast之后和目的基因的相似度

发自小木虫IOS客户端
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6楼2016-04-29 18:37:49
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804371539

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by i760912798 at 2016-04-29 17:31:43
公司一般都负责序列拼接的

我忘了让他拼接了。。。

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7楼2016-04-29 18:38:03
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8楼2016-04-29 19:05:33
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卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
7楼: Originally posted by 804371539 at 2016-04-29 18:38:03
我忘了让他拼接了。。。
...

时候不长的话何以给他发邮件，把你测序订单序列号告诉他，让他拼接。
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10楼2016-04-29 21:27:50
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