版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
应《网络安全法》要求,自2017年10月1日起,未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用,请尽快对帐号进行手机号验证,感谢您的理解与支持!
24小时热门版块排行榜
>
论坛更新日志
(2561)
>
虫友互识
(169)
>
文献求助
(162)
>
导师招生
(109)
>
休闲灌水
(84)
>
论文投稿
(71)
>
考博
(49)
>
基金申请
(38)
>
仿真模拟
(31)
>
硕博家园
(29)
>
博后之家
(25)
>
找工作
(19)
>
考研
(18)
>
攻关文献(高奖励)
(17)
>
绿色求助(高悬赏)
(16)
>
论文道贺祈福
(15)
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
生物医药区
»
分子生物
»
综合其他
»
测序结果使用MAGA5比对后有很多空白,不知何原因,请高手指导!
7
1/1
返回列表
查看: 1476 | 回复: 6
只看楼主
@他人
存档
新回复提醒
(忽略)
收藏
在APP中查看
芳芳208
铜虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 927
帖子: 87
在线: 15.4小时
虫号: 2048996
注册: 2012-10-08
性别:
MM
专业: 土壤生态学
[
求助
]
测序结果使用MAGA5比对后有很多空白,不知何原因,请高手指导!
如题,如图,别人的测序结果比对后未出现该问题,貌似这样也不影响后续建树,但不知何原因,请遇到过该问题的童鞋分析指导下!
未命名.jpg
回复此楼
» 猜你喜欢
宠物寄生虫防治:氟雷拉纳阻断GABA受体,持效12周驱杀跳蚤蜱虫
已经有0人回复
为呼吸打开通道:依伐卡托的科学之旅
已经有1人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有284人回复
Dordaviprone(ONC201):小分子药物在中线胶质瘤中的应用
已经有0人回复
依喜替康:新型喜树碱衍生物的研究进展
已经有1人回复
膀胱癌靶向治疗新选择:厄达替尼作用机制与耐药研究进展
已经有0人回复
从水母到实验室:腔肠素的发现历程与生物发光奥秘
已经有1人回复
线粒体氧化磷酸化的新靶点:S-Gboxin的发现与研究进展
已经有0人回复
PROTAC药物开发选择VHL配体:MDK-7526以87%出口向量占有率成首选
已经有0人回复
MCC950:NLRP3炎症小体特异性抑制剂的科研应用与前景
已经有0人回复
康替唑胺研发17年:如何解决多重耐药菌感染难题
已经有0人回复
哼哼哈嘿,快使用双截棍!
1楼
2012-11-19 10:00:21
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
芳芳208
铜虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 927
帖子: 87
在线: 15.4小时
虫号: 2048996
注册: 2012-10-08
性别:
MM
专业: 土壤生态学
还有测序结果中竟然出现了N、B,这个需要怎样处理呢?
赞
一下
回复此楼
哼哼哈嘿,快使用双截棍!
2楼
2012-11-19 10:02:12
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
gyesang
荣誉版主
(著名写手)
专家经验: +24
MolEPI: 31
应助: 599
(博士)
贵宾: 2.689
金币: 24334.9
散金: 1088
红花: 88
沙发: 2
帖子: 2327
在线: 623.1小时
虫号: 849017
注册: 2009-09-16
性别: GG
专业: 细胞信号转导
管辖:
分子生物
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流
2012-11-19 13:55:43
这个是本身测序的问题,不是软件比对的问题,当中有条序列,多了个T,多了个CC,不想有空白的话可以把这条去掉,余下的序列在比对。
N表示测序时对那个位点的碱基无法判读,你具体的可以自己看下峰形图。
赞
一下
回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼
2012-11-19 10:30:35
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
芳芳208
铜虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 927
帖子: 87
在线: 15.4小时
虫号: 2048996
注册: 2012-10-08
性别:
MM
专业: 土壤生态学
引用回帖:
3楼
:
Originally posted by
gyesang
at 2012-11-19 10:30:35
这个是本身测序的问题,不是软件比对的问题,当中有条序列,多了个T,多了个CC,不想有空白的话可以把这条去掉,余下的序列在比对。
N表示测序时对那个位点的碱基无法判读,你具体的可以自己看下峰形图。
非常感谢指导!可是下面的那条多了几个碱基的序列不是测序得到的,而是我数据库比对之后数据库中提供的序列,还可以删掉吗?
赞
一下
回复此楼
哼哼哈嘿,快使用双截棍!
4楼
2012-11-19 20:15:13
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
gyesang
荣誉版主
(著名写手)
专家经验: +24
MolEPI: 31
应助: 599
(博士)
贵宾: 2.689
金币: 24334.9
散金: 1088
红花: 88
沙发: 2
帖子: 2327
在线: 623.1小时
虫号: 849017
注册: 2009-09-16
性别: GG
专业: 细胞信号转导
管辖:
分子生物
引用回帖:
4楼
:
Originally posted by
芳芳208
at 2012-11-19 20:15:13
非常感谢指导!可是下面的那条多了几个碱基的序列不是测序得到的,而是我数据库比对之后数据库中提供的序列,还可以删掉吗?...
你的意思,多的那个是你的标准序列,数据库里面的也不一定是对的,你测序了那么多都少碱基,要验证的话,可以从不同细胞分别提取RNA然后逆转录,克隆你的目的基因,进行测序
赞
一下
(1人)
回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼
2012-11-19 20:59:52
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
芳芳208
铜虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 927
帖子: 87
在线: 15.4小时
虫号: 2048996
注册: 2012-10-08
性别:
MM
专业: 土壤生态学
引用回帖:
5楼
:
Originally posted by
gyesang
at 2012-11-19 20:59:52
你的意思,多的那个是你的标准序列,数据库里面的也不一定是对的,你测序了那么多都少碱基,要验证的话,可以从不同细胞分别提取RNA然后逆转录,克隆你的目的基因,进行测序...
哦,有点复杂了,那我再摸索下,大体明白该怎样做了,谢谢!
赞
一下
回复此楼
哼哼哈嘿,快使用双截棍!
6楼
2012-11-19 22:07:40
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
gyesang
荣誉版主
(著名写手)
专家经验: +24
MolEPI: 31
应助: 599
(博士)
贵宾: 2.689
金币: 24334.9
散金: 1088
红花: 88
沙发: 2
帖子: 2327
在线: 623.1小时
虫号: 849017
注册: 2009-09-16
性别: GG
专业: 细胞信号转导
管辖:
分子生物
【答案】应助回帖
引用回帖:
6楼
:
Originally posted by
芳芳208
at 2012-11-19 22:07:40
哦,有点复杂了,那我再摸索下,大体明白该怎样做了,谢谢!...
不客气,相互交流嘛!
赞
一下
回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
7楼
2012-11-20 10:44:03
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
相关版块跳转
新药研发
药学
药品生产
分子生物
微生物
动植物
生物科学
医学
我要订阅楼主
芳芳208
的主题更新
7
1/1
返回列表
如果回帖内容含有宣传信息,请如实选中。否则帐号将被全论坛禁言
普通表情
龙
兔
虎
猫
百度网盘
|
360云盘
|
千易网盘
|
华为网盘
在新窗口页面中打开自己喜欢的网盘网站,将文件上传后,然后将下载链接复制到帖子内容中就可以了。
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭
确定