应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 测序结果使用MAGA5比对后有很多空白，不知何原因，请高手指导！
51/1返回列表
查看: 1319  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

芳芳208

铜虫 (小有名气)

[求助] 测序结果使用MAGA5比对后有很多空白，不知何原因，请高手指导！

如题，如图，别人的测序结果比对后未出现该问题，貌似这样也不影响后续建树，但不知何原因，请遇到过该问题的童鞋分析指导下！

未命名.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢
哼哼哈嘿，快使用双截棍！
1楼 2012-11-19 10:00:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
引用回帖:
4楼: Originally posted by 芳芳208 at 2012-11-19 20:15:13
非常感谢指导！可是下面的那条多了几个碱基的序列不是测序得到的，而是我数据库比对之后数据库中提供的序列，还可以删掉吗？...

你的意思，多的那个是你的标准序列，数据库里面的也不一定是对的，你测序了那么多都少碱基，要验证的话，可以从不同细胞分别提取RNA然后逆转录，克隆你的目的基因，进行测序
赞一下(1人) 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2012-11-19 20:59:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

芳芳208

铜虫 (小有名气)
还有测序结果中竟然出现了N、B，这个需要怎样处理呢？
赞一下 回复此楼
哼哼哈嘿，快使用双截棍！
2楼2012-11-19 10:02:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-19 13:55:43
这个是本身测序的问题，不是软件比对的问题，当中有条序列，多了个T，多了个CC，不想有空白的话可以把这条去掉，余下的序列在比对。

N表示测序时对那个位点的碱基无法判读，你具体的可以自己看下峰形图。
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2012-11-19 10:30:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

芳芳208

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2012-11-19 10:30:35
这个是本身测序的问题，不是软件比对的问题，当中有条序列，多了个T，多了个CC，不想有空白的话可以把这条去掉，余下的序列在比对。

N表示测序时对那个位点的碱基无法判读，你具体的可以自己看下峰形图。

非常感谢指导！可是下面的那条多了几个碱基的序列不是测序得到的，而是我数据库比对之后数据库中提供的序列，还可以删掉吗？
赞一下 回复此楼
哼哼哈嘿，快使用双截棍！
4楼2012-11-19 20:15:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 情人节自我反思：在爱情中有过遗憾吗？ +5 瞬息宇宙 2026-02-15 6/300 2026-02-18 12:51 by 月下雪林
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 11:09 by lqtl9djx19
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 10:54 by lqtl9djx19
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 10:39 by lqtl9djx19
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 08:53 by lqtl9djx19
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 08:38 by lqtl9djx19
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-17 4/200 2026-02-18 07:55 by lotyj5cz79
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:40 by lotyj5cz79
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:38 by lotyj5cz79
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:23 by lotyj5cz79
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:08 by lotyj5cz79
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-16 3/150 2026-02-18 06:53 by lotyj5cz79
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 00:40 by tk2gfblvuz
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 4/200 2026-02-18 00:23 by tk2gfblvuz
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-17 23:40 by tk2gfblvuz
[基金申请] 基金正文30页指的是报告正文还是整个申请书 +3 successhe 2026-02-16 4/200 2026-02-17 20:56 by successhe
[基金申请] 今年春晚有几个节目很不错，点赞！ +5 瞬息宇宙 2026-02-16 6/300 2026-02-17 12:49 by jymy19840415
[微米和纳米] 球磨粉体时遇到了大的问题，请指教！ 10+3 6sbiam 2026-02-12 15/750 2026-02-16 15:03 by tgzxzqj
[基金申请] 过年走亲戚时感受到了所开私家车的鄙视链 +3 瞬息宇宙 2026-02-15 5/250 2026-02-16 14:23 by aspect3000
[硕博家园] 江汉大学解明教授课题组招博士研究生/博士后 +3 cleverlyy 2026-02-12 3/150 2026-02-12 21:02 by qsdf1
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭