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voidecho

新虫 (初入文坛)

[求助] 引物设计问题求助 已有5人参与

我在NCBI上设计了一对引物  其中反向引物为:AATGGGTCCTCCTCCTCCTC     TCC重复太多,会不会对PCR有影响,求助!
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mlxmiao

木虫 (著名写手)

2楼2016-03-29 14:18:28
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汪浩的良

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
voidecho: 金币+2 2016-04-01 21:59:57
退火温度有点高,不过应该问题不大,可以先试试梯度PCR,找到合适的退火温度。
3楼2016-03-29 15:03:25
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卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
voidecho: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-04-01 21:59:41
理论上是这样的,如果米有合适的你可以试试这对引物,如果退火温度比较高可以两步法,退火延伸合并;也可以做个touchdown程序。
4楼2016-03-29 16:58:30
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still2008

至尊木虫 (著名写手)

破碎世界的守护者

理论是理论,终究还是要试一下。

发自小木虫IOS客户端
有时一本正经,有时胡言乱语。
5楼2016-03-30 14:15:30
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pond

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
当然有影响了!会发生这对引物之间配对,那样就p不出来了
6楼2016-03-30 16:23:58
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tbsjxy

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
voidecho: 金币+3, ★★★很有帮助 2016-04-01 22:00:12
会形成引物二聚体,没有发夹结构,GC含量还可以,最好换一条,强行用的话扩增效率较低,正向引物好的话,应该可以扩出目的条带
该用户由于违规已被禁言一辈子
7楼2016-03-30 16:50:53
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王爱沫1

禁虫 (小有名气)

感谢参与,应助指数 +1
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8楼2016-03-30 17:01:55
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catheyyling

铜虫 (小有名气)

你试试 如果做的不好 根据兼并密码子原则可以把5端或者中间的一两个碱基改一下 先把基因扩出来

发自小木虫IOS客户端
catheysun
9楼2016-04-02 20:58:45
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