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酶的保守序列会因为外界某种因素发生改变吗?

作者 yee~
来源: 小木虫 250 5 举报帖子
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本人最近在探究一种酶,但是这酶和现一种已知酶,序列极其相似,但是保守序列出有些不同。想着,这两个会不会就是同一个酶,而因为外界某种因素,但是其保守序列改变。对生物不是很懂,望大佬指教!

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  • 精华评论
  • fuyuandj86

    说得太含糊了,不同到什么程度。已知的酶和你要研究的酶是homolog, ortholog还是paralog?

  • 原海亮

    通过信息学的比对,给未知基因或蛋白的功能研究提供参考,这是常用的思路,其实重要的是如何去验证你的猜想。

           你目前在研究的酶已经有很多研究文献了么?保守序列是如何确定的(一般是同家族的蛋白有一部分序列高度稳定)?与已知酶序列同源性有多高?等等

           如果想验证两个酶在进化上是否有相关性,一方面可以通过信息学进行比对分析建立进化树。另一方面可以从功能学方面去验证两个酶是否有相似的功能。最后,也应考虑不同酶的来源,宿主的生存环境,代谢途径等等,来为你的猜想提供数据支持,从而验证猜想。

           祝好!

  • 原海亮

    引用回帖:
    5楼: Originally posted by yee~ at 2021-06-19 09:00:40
    您好,谢谢您的回答!
    现在这个的文献不是很多,大多都是通过群落中PCR筛选和宏基因组分析,发现这个新的基因片段,有进行序列对比,两者相似度高,但又有明显不同,功能保守序列活性中心,结合位点以及质子通道氨 ...

    你可以查阅一下已知酶的研究资料,了解一下已知酶从发现到功能研究的实验策略,比如酶蛋白是否可以异源表达,使用原核系统还是真核系统,酶蛋白的验证方法是什么,酶活力的测定方法有哪些等等。

    研究宏基因组里筛选获得的基因,你可以通过异源表达的方式将该基因克隆至合适宿主,通过对该未知酶的表达、功能验证(可参考已知酶的研究方法)来确定所谓的保守序列的变化,是否影响或改变了酶的功能及活性,从而给未知酶的研究提供一些数据

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