小木虫

当前位置：首页 > 分子模拟 >autodock 对接前辈，请不吝赐教，在此谢过～～

autodock 对接前辈，请不吝赐教，在此谢过～～

作者 坚守2012: 来源: 小木虫 350 7 举报帖子

我做对接时遇到的一个问题，提示错误：
autogrid4: ERROR:  Too many atoms in receptor PDBQT file macro.pdbqt;
autogrid4: ERROR:  -- the maximum number of atoms, AG_MAX_ATOMS, allowed is 32768.
autogrid4: ERROR:  Sorry, AutoGrid cannot continue.

看之前的帖子是要删一些原子，是怎么删呢？在ADT里删除还是在Pymol里删除，能否讲解一二，谢谢。返回小木虫查看更多

今日热帖

精华评论

江南的酱

这个pdbqt不是在autodock里生成的？
坚守2012

引用回帖:
2脗楼: Originally posted by 陆颅脛脧碌脛陆麓 at 2021-05-12 22:29:03
脮芒赂枚pdbqt虏禄脢脟脭脷autodock脌茂脡煤鲁脡碌脛拢驴

脢脟脭脷autodock 脌茂脡煤鲁脡碌脛拢卢脢脺脤氓录脫脟芒/录脝脣茫碌莽潞脡隆拢隆拢潞贸卤拢麓忙碌脛
圈内与圈外

原子太多了，如果用的整个蛋白，删一两条链
坚守2012

引用回帖:
4脗楼: Originally posted by 脠娄脛脷脫毛脠娄脥芒 at 2021-05-13 06:36:33
脭颅脳脫脤芦露脿脕脣拢卢脠莽鹿没脫脙碌脛脮没赂枚碌掳掳脳拢卢脡戮脪禄脕陆脤玫脕麓

脦脪脭脷autodock脌茂脡戮鲁媒脕麓潞贸拢卢鲁脤脨貌陆脨卤篓麓铆脕脣拢卢虏禄脰陋碌脌脢脟虏禄脢脟虏脵脳梅虏禄露脭隆�
，
坚守2012

引用回帖:
7脗楼: Originally posted by tpwd3636 at 2021-05-13 20:33:37
脫脙autodock禄貌脮脽pymol麓娄脌铆脡戮鲁媒脠脽脫脿碌脛脕麓禄貌脮脽掳卤禄霉脣谩虏脨禄霉录麓驴脡隆拢

陆芒戮枚脕脣拢卢脨禄脨禄