求助，使用amber18的cpptraj从轨迹文件中提取rst文件缺少速度。
我想使用cpptraj从动力学轨迹文件中提取某一帧作为下一个动力学窗口的起始rst文件。指令操作如下：cpptraj
parm model.prmtop
trajin xxx.cdf 2000 2000 1
trajout 2000.rst7 restart
go
结果会生成一个2000.rst文件，但是我在使用这个文件进行下一步计算的时候，会报错，ERROR: I could not find enough velocities in 13.5.rst7
此外，用这个指令生成的rst7文件大小与动力学自动保存的rst文件大小也不同。
想请问下这是什么原因啊？应该怎么修改cpptraj指令呢？谢谢~！
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京公网安备 11010802022153号
更正一下，指令里的2000.rst7 跟报错中的13.5.rst7是同一个文件。文件名实际上是一致的，文中打错了。
你的轨迹中没有保存速度，你可以重新加热生成速度，固定住所有的骨架原子
amber轨迹一般不保存速度的，因为分析很少有用到
我使用动力学结束之后自动保存的那个rst文件可以正常跑。因为最后一帧的构象不是我想要的 所以就想从轨迹文件中截取一个自己需要的
，
非常感谢您的提醒，amber轨迹里没有速度信息。我想到怎么办了。我打算重新跑动力学，调整一下参数 让轨迹文件里保存速度信息。