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zzy329372570银虫 (小有名气)
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求助，使用amber18的cpptraj从轨迹文件中提取rst文件缺少速度。
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我想使用cpptraj从动力学轨迹文件中提取某一帧作为下一个动力学窗口的起始rst文件。指令操作如下：cpptraj parm model.prmtop trajin xxx.cdf 2000 2000 1 trajout 2000.rst7 restart go 结果会生成一个2000.rst文件，但是我在使用这个文件进行下一步计算的时候，会报错，ERROR: I could not find enough velocities in 13.5.rst7 此外，用这个指令生成的rst7文件大小与动力学自动保存的rst文件大小也不同。 想请问下这是什么原因啊？应该怎么修改cpptraj指令呢？谢谢~！ |
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zzy3293725704楼2021-04-23 18:44:07
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