| 查看: 1381 | 回复: 5 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者zzy329372570将赠送您 5 个金币 | ||
zzy329372570银虫 (小有名气)
|
[求助]
求助，使用amber18的cpptraj从轨迹文件中提取rst文件缺少速度。
|
|
|
我想使用cpptraj从动力学轨迹文件中提取某一帧作为下一个动力学窗口的起始rst文件。指令操作如下：cpptraj parm model.prmtop trajin xxx.cdf 2000 2000 1 trajout 2000.rst7 restart go 结果会生成一个2000.rst文件，但是我在使用这个文件进行下一步计算的时候，会报错，ERROR: I could not find enough velocities in 13.5.rst7 此外，用这个指令生成的rst7文件大小与动力学自动保存的rst文件大小也不同。 想请问下这是什么原因啊？应该怎么修改cpptraj指令呢？谢谢~！ |
回复此楼» 猜你喜欢
博士读完未来一定会好吗
已经有17人回复
-
心脉受损
已经有5人回复
-
Springer期刊投稿求助
已经有4人回复
-
读博
已经有3人回复
-
小论文投稿
已经有3人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有9人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有8人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
zzy329372570
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 342.6
- 帖子: 112
- 在线: 9.9小时
- 虫号: 4147933
- 注册: 2015-10-15
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2021-04-23 18:38:29
hdx1991
新虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 15423.3
- 散金: 1277
- 红花: 9
- 沙发: 5
- 帖子: 2782
- 在线: 216.7小时
- 虫号: 4093952
- 注册: 2015-09-22
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
3楼2021-04-23 18:43:20
hdx1991
新虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 15423.3
- 散金: 1277
- 红花: 9
- 沙发: 5
- 帖子: 2782
- 在线: 216.7小时
- 虫号: 4093952
- 注册: 2015-09-22
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
zzy3293725704楼2021-04-23 18:44:07
zzy329372570
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 342.6
- 帖子: 112
- 在线: 9.9小时
- 虫号: 4147933
- 注册: 2015-10-15
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
5楼2021-04-23 18:47:47
zzy329372570
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 342.6
- 帖子: 112
- 在线: 9.9小时
- 虫号: 4147933
- 注册: 2015-10-15
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
6楼2021-04-23 19:47:56