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请教:qRT-PCR验证RNA-seq的结果

作者 erxiaobio9933
来源: 小木虫 200 4 举报帖子
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在很多文献中,用qRT-PCR验证RNA-seq的结果中,往往是qRT-PCR有误差线(error bar)而RNA-seq没有,这不是个例,很多文献的图就是这样的。我贴了几个文献的截图,但是这些文献表明进行测序都是至少三次生物学重复的,所以没有误差线肯定不是因为没有做生物学重复。但是为什么RNA-seq没有误差线呢?想请教一下专业的回答。谢谢各位赐教

请教:qRT-PCR验证RNA-seq的结果
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请教:qRT-PCR验证RNA-seq的结果-1
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  • 精华评论
  • snhajn

    你这个问题问得非常好

  • yuehedou

    我的理解是,RNA-Seq的基因表达变化可信度主要是看P值的,这通常是基于样品整体基因检测情况并且基于连续性矫正的,还跟个体基因表达丰度相关,因此看重复间误差意义不大。但qRT-PCR主要是单个基因表达的独立检测,就只能看误差线了。

  • erxiaobio9933

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by yuehedou at 2021-02-11 09:38:27
    我的理解是,RNA-Seq的基因表达变化可信度主要是看P值的,这通常是基于样品整体基因检测情况并且基于连续性矫正的,还跟个体基因表达丰度相关,因此看重复间误差意义不大。但qRT-PCR主要是单个基因表达的独立检测, ...

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