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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请教：qRT-PCR验证RNA-seq的结果
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【悬赏金币】回答本帖问题，作者erxiaobio9933将赠送您 50 个金币

erxiaobio9933

木虫 (初入文坛)

[求助] 请教：qRT-PCR验证RNA-seq的结果 已有1人参与

在很多文献中，用qRT-PCR验证RNA-seq的结果中，往往是qRT-PCR有误差线（error bar）而RNA-seq没有，这不是个例，很多文献的图就是这样的。我贴了几个文献的截图，但是这些文献表明进行测序都是至少三次生物学重复的，所以没有误差线肯定不是因为没有做生物学重复。但是为什么RNA-seq没有误差线呢？想请教一下专业的回答。谢谢各位赐教

请教：qRT-PCR验证RNA-seq的结果
QQ截图20210210111421.jpg


请教：qRT-PCR验证RNA-seq的结果-1
QQ截图20210210132118.jpg
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1楼 2021-02-10 13:32:03
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snhajn

新虫 (著名写手)
你这个问题问得非常好

发自小木虫Android客户端
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2楼2021-02-10 16:57:04
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yuehedou

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我的理解是，RNA-Seq的基因表达变化可信度主要是看P值的，这通常是基于样品整体基因检测情况并且基于连续性矫正的，还跟个体基因表达丰度相关，因此看重复间误差意义不大。但qRT-PCR主要是单个基因表达的独立检测，就只能看误差线了。
赞一下(3人) 回复此楼
每天都为自己的无知而羞耻！
3楼2021-02-11 09:38:27
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yuanbingzhan


发自小木虫Android客户端
4楼2021-02-12 12:27:52
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erxiaobio9933

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yuehedou at 2021-02-11 09:38:27
我的理解是，RNA-Seq的基因表达变化可信度主要是看P值的，这通常是基于样品整体基因检测情况并且基于连续性矫正的，还跟个体基因表达丰度相关，因此看重复间误差意义不大。但qRT-PCR主要是单个基因表达的独立检测， ...

感谢您的回答。
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5楼2021-02-12 18:00:22
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