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erxiaobio9933

木虫 (初入文坛)

[求助] 请教:qRT-PCR验证RNA-seq的结果 已有1人参与

在很多文献中,用qRT-PCR验证RNA-seq的结果中,往往是qRT-PCR有误差线(error bar)而RNA-seq没有,这不是个例,很多文献的图就是这样的。我贴了几个文献的截图,但是这些文献表明进行测序都是至少三次生物学重复的,所以没有误差线肯定不是因为没有做生物学重复。但是为什么RNA-seq没有误差线呢?想请教一下专业的回答。谢谢各位赐教

请教:qRT-PCR验证RNA-seq的结果
QQ截图20210210111421.jpg


请教:qRT-PCR验证RNA-seq的结果-1
QQ截图20210210132118.jpg
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yuehedou

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我的理解是,RNA-Seq的基因表达变化可信度主要是看P值的,这通常是基于样品整体基因检测情况并且基于连续性矫正的,还跟个体基因表达丰度相关,因此看重复间误差意义不大。但qRT-PCR主要是单个基因表达的独立检测,就只能看误差线了。
每天都为自己的无知而羞耻!
3楼2021-02-11 09:38:27
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snhajn

新虫 (著名写手)

2楼2021-02-10 16:57:04
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4楼2021-02-12 12:27:52
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erxiaobio9933

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yuehedou at 2021-02-11 09:38:27
我的理解是,RNA-Seq的基因表达变化可信度主要是看P值的,这通常是基于样品整体基因检测情况并且基于连续性矫正的,还跟个体基因表达丰度相关,因此看重复间误差意义不大。但qRT-PCR主要是单个基因表达的独立检测, ...

感谢您的回答。
5楼2021-02-12 18:00:22
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