三代基因组测序疑问
1. 三代基因组测序,PacBio平台的数据,读长reads长度是多少?插入片段长度是多少?
2. 三代和二代,也有双端测序吗?也是输出1.fq,2.fq吗?还是就输出一个fq文件?
3. 背景是我要模拟一个三代测序数据,比较几个比对,组装软件的差异
谢谢大家
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1. 三代基因组测序,PacBio平台的数据,读长reads长度是多少?插入片段长度是多少?
2. 三代和二代,也有双端测序吗?也是输出1.fq,2.fq吗?还是就输出一个fq文件?
3. 背景是我要模拟一个三代测序数据,比较几个比对,组装软件的差异
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pacbio插入片段20-30kb左右,三代测序没有双端测序的说法,输出的是bam文件
"PaSS: a sequencing simulator for PacBio sequencing",https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31226925/,