得到一株菌的全基因组，怎么知道和哪个已公布的菌株关系最近？
请问能否在NCBI上提交全基因组进行blast？
提交部分序列的话到是能出结果，但提交不同序列结果也不一样，我想最准的应该是全基因组blast，但提交后网页总是刷新出不来结果，1小时后网页就出错了。不知是我这个思路不对，还是目前的技术不支持？是不是有其他的方法？
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这个几乎不可能，基因组序列太大，blast比对无法完成，最好的办法是进行本地blast
全基因组不要用blast，试下ani 或者mash
先比较16S或18S，同源性高的菌种下载基因组序列，在线分析ANI和GGDC
JSpecies Web Server (https://jspecies.ribohost.com/jspeciesws)
genome-to-genome distance calculator (GGDC) website (https://ggdc.dsmz.de/distcalc2.php)，
比较16S或18S就够了