| 查看: 1849 | 回复: 4 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者s07060785将赠送您 100 个金币 | ||
s07060785新虫 (初入文坛)
|
[求助]
得到一株菌的全基因组，怎么知道和哪个已公布的菌株关系最近？已有2人参与
|
|
|
请问能否在NCBI上提交全基因组进行blast？ 提交部分序列的话到是能出结果，但提交不同序列结果也不一样，我想最准的应该是全基因组blast，但提交后网页总是刷新出不来结果，1小时后网页就出错了。不知是我这个思路不对，还是目前的技术不支持？是不是有其他的方法？ |
回复此楼» 猜你喜欢
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有4人回复
-
真诚求助：手里的省社科项目结项要求主持人一篇中文核心，有什么渠道能发核心吗
已经有8人回复
-
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有5人回复
-
论文投稿，期刊推荐
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有4人回复
-
孩子确诊有中度注意力缺陷
已经有14人回复
-
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
-
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有5人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有4人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
nanhu1984
银虫 (正式写手)
- 应助: 33 (小学生)
- 金币: 2251.2
- 散金: 13
- 红花: 13
- 帖子: 701
- 在线: 245.4小时
- 虫号: 2531775
- 注册: 2013-07-04
- 专业: 病原细菌、细菌感染与宿主
2楼2020-06-23 17:57:53
zyz2007
金虫 (正式写手)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 3523.7
- 红花: 6
- 帖子: 439
- 在线: 438.1小时
- 虫号: 445761
- 注册: 2007-10-28
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
3楼2020-06-23 20:53:12
hhaidong
木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 2574.7
- 散金: 1095
- 红花: 4
- 帖子: 586
- 在线: 262.6小时
- 虫号: 182594
- 注册: 2006-02-12
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
【答案】应助回帖
|
先比较16S或18S，同源性高的菌种下载基因组序列，在线分析ANI和GGDC JSpecies Web Server (https://jspecies.ribohost.com/jspeciesws) genome-to-genome distance calculator (GGDC) website (https://ggdc.dsmz.de/distcalc2.php) |
4楼2020-07-01 09:22:50
dlzhao516
至尊木虫 (职业作家)
- 应助: 38 (小学生)
- 金币: 24235.5
- 红花: 13
- 帖子: 3540
- 在线: 1772.6小时
- 虫号: 455482
- 注册: 2007-11-10
- 专业: 病原细菌与放线菌生物学
5楼2020-10-12 01:54:11