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s07060785新虫 (初入文坛)
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[求助]
得到一株菌的全基因组，怎么知道和哪个已公布的菌株关系最近？已有2人参与
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请问能否在NCBI上提交全基因组进行blast？ 提交部分序列的话到是能出结果，但提交不同序列结果也不一样，我想最准的应该是全基因组blast，但提交后网页总是刷新出不来结果，1小时后网页就出错了。不知是我这个思路不对，还是目前的技术不支持？是不是有其他的方法？ |
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zyz2007
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3楼2020-06-23 20:53:12
nanhu1984
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【答案】应助回帖
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先比较16S或18S，同源性高的菌种下载基因组序列，在线分析ANI和GGDC JSpecies Web Server (https://jspecies.ribohost.com/jspeciesws) genome-to-genome distance calculator (GGDC) website (https://ggdc.dsmz.de/distcalc2.php) |
4楼2020-07-01 09:22:50
dlzhao516
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5楼2020-10-12 01:54:11