用ONIOM关键词算吸收,请问可以看分子轨道吗?
用ONIOM关键词算吸收,请问可以看分子轨道吗?得到的chk文件转化成fchk文件会造成数据丢失,在Gaussview里无法打开。
输入文件:
%chk=packing1_guest_abs_ONIOM.chk
%nprocshared=20
%mem=12000MB
#p oniom(PBE1PBE/genecp td=(singlets,nstates=20,direct):uff)=embedcharge test
absorption
0 1 0 1 0 1
C 26.8564499443,11.2974579201,22.535374973 L
C 26.4312706227,12.5897273583,22.1656391631 L
C 25.079756231,12.9545921491,22.2751903325 L
C 24.1694372817,11.9921553489,22.7275839214 L
C 24.5970630014,10.7317662379,23.1036871816 L
C 25.9390511173,10.3569276904,23.0333609336 L
H 27.8993300059,11.0327314821,22.4387729637 L
中间略到好多原子
C 33.1316875537,25.2458454493,20.5017776507 L
H 34.6438528841,23.5215656048,22.9626666632 L
H 34.5537458777,23.6020072384,20.5486274853 L
C 33.0912226367,25.4397359482,19.0253450849 L
O 33.7582638392,24.7213374764,18.3023322806 L
O 32.3461046073,26.4006128366,18.4698156726 L
C H N O 0
6-31G**
****
Ir 0
LANL2DZ
****
Ir 0
LANL2DZ 返回小木虫查看更多
你的输出文件明明显示是用G16 C01计算的。但是你为什么要加载G16 A03去进行formchk? 这肯定不行的呀。你要注意版本 要 一模一样。
非常感谢老师,我一定铭记于心!
chk文件已转换成fchk文件
fchk文件用GaussView打开,显示有问题,请问这是什么原因啊?
1592817157(1).jpg
这是因为你用的GV6.06版本去打开 G16 C.01 计算出来的fchk就会出现此类错误。原则上你应该用最新的GV6.11版本才可以正常打开。
但是这个问题不是没法抢救一下。
在这个弹出错误窗口后, 你需要点了ok之后选择用记事本打开这个文件。这时候就会定位到出错的那行。你会看到写着 MM Charges 的地方。这时候你需要把 最后的那个s删掉 然后记得一定要打一个空格代替那个s的位置, 也就是 把 MM charges 变成 MM charge 保存就可以了 然后再打开就可以了。
好的,非常感谢老师!
我进行操作之后是显示关键词错误,想请教一下这怎么解决啊,谢谢老师!
1592898772(1).jpg
我算了一下 转换过程如动图 没有问题可以打开. 而且转换完的文件开头如图2 。不知道你这截图里的那行关键词哪里来的
修改fchk.gif
图2
谢谢老师,我把关键词那行都删了 同时按照您的方法改就解决了!
谢谢老师的指点,辛苦啦!
借一下楼,老师您好,我想得到得到激发态的HOMO-LUMO图和数据,我用oniom得到激发态的结果后在怎么做单点计算,我之前是把qm分子坐标拿出来做,但明显不对,这样就无法考虑分子间的作用力。图一是我做的激发态的结果,图二是之前单独拿出qm分子算的单点计算,明显不对。要怎样写命令和输入文件才可以,我刚接触计算不久,还请老师多多指点,感谢!
图二.png
图一.png
,