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金纳米棒修饰DNA

作者 油条vs豆浆
来源: 小木虫 550 11 举报帖子
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大家好,我最近尝试往金纳米棒上修饰巯基化DNA,利用的是低pH高盐法修饰,从紫外上能看到260有明显的DNA吸收峰,合成之后的产物也非常稳定,多次离心都能很好地收集到产物(应该不存在DNA脱落等因素);
但是在尝试结合互补链DNA的时候却一直都不能够成功(验证方式:1. 紫外看产物260吸收峰无明显变化;2.投入与修饰探针等量的互补链DNA,在结合后未发现上清中DNA含量变少),想请教下大家这是哪方面出问题了?
尝试过的影响因素:1、DNA在金纳米棒上的修饰比例;2、反应的温度、pH等 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • supernatural

    存在位阻,DNA不容易互补配对
    你可以尝试先让DNA互补配对,再把双链DNA连接到金表面

  • o看i



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  • 油条vs豆浆

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by supernatural at 2020-06-12 17:24:03
    存在位阻,DNA不容易互补配对
    你可以尝试先让DNA互补配对,再把双链DNA连接到金表面

    谢谢建议,你的这种方法我也尝试过,但似乎DNA双链在低pH高盐环境下容易解链,没能成功把互补链留住;我后续再尝试下直接修饰吧,就是时间相对长一点。
    另外,想和你探讨一下关于这个DNA链的空间位阻影响,这种位阻是不是主要是DNA链离金表面太近,如果我把spacer序列长度加大一点,是不是会一定程度消除这种影响?其实我原来已经加了5个A了,我现在计划再加一点,因为我的实验这个互补链上还需要继续加互补链,做杂交链反应形成个长链聚合物,所以还是优先想考虑解决这个位阻问题

  • supernatural

    引用回帖:
    5楼: Originally posted by 油条vs豆浆 at 2020-06-17 10:27:06
    谢谢建议,你的这种方法我也尝试过,但似乎DNA双链在低pH高盐环境下容易解链,没能成功把互补链留住;我后续再尝试下直接修饰吧,就是时间相对长一点。
    另外,想和你探讨一下关于这个DNA链的空间位阻影响,这种位 ...

    位阻主要是静电排斥和空间位阻,如果你后期还要加互补链,我觉得还是先杂交再偶联好些,只要设计的互补碱基超过10个,我感觉杂交后的双链没有那么容易解链。关于加spacer,已经加了spacer了,再加spacer感觉影响应该不是很大。

  • 油条vs豆浆

    引用回帖:
    6楼: Originally posted by supernatural at 2020-06-17 11:18:49
    位阻主要是静电排斥和空间位阻,如果你后期还要加互补链,我觉得还是先杂交再偶联好些,只要设计的互补碱基超过10个,我感觉杂交后的双链没有那么容易解链。关于加spacer,已经加了spacer了,再加spacer感觉影响应 ...

    好的,谢谢

  • 慧儿~

    可以留个联系方式吗  我最近也遇到了这样的问题

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