请问G4方法能不能算的动三四十个原子的分子
请问G4方法能算的动三四十个原子的分子结构吗。我看别人的文献中用G4算乙基咔唑的能量,可是我跑了15个小时了,还没有算完,目前的状态是opt结束了,后面就一直卡着没结果,实际上只算了7个小时。用的服务器,36核算的。我的输入文件如下:
# G4 geom=connectivity
necz
0 1
C -1.14579300 0.49395000 -0.00001300
C -0.96842200 -0.91454000 0.00001300
C 0.45961100 -1.15076200 0.00000700
C 1.10413000 0.12488100 -0.00002000
N 0.10752000 1.12339000 -0.00002400
C 1.21791600 -2.32663400 0.00002200
C 2.60766900 -2.24443400 0.00000500
C 3.23702200 -0.98827700 -0.00003000
C 2.50542400 0.19988000 -0.00004100
C -2.42249000 1.06833400 -0.00002600
C -3.52355000 0.21048700 -0.00000800
C -3.36228800 -1.18688000 0.00002100
C -2.08817400 -1.75394600 0.00003100
C 0.18141300 2.59551500 -0.00007000
C 1.57214900 3.22560800 0.00011600
H 0.72562900 -3.29068700 0.00004600
H 3.20564100 -3.14553000 0.00001300
H 4.31787600 -0.93431500 -0.00004600
H 3.03074100 1.13873800 -0.00007000
H -2.56474100 2.13969000 -0.00005200
H -4.52066400 0.63070900 -0.00001900
H -4.23598900 -1.82446300 0.00003300
H -1.96889900 -2.82973300 0.00005100
H -0.36611100 2.95292500 -0.87792300
H -0.36635300 2.95297800 0.87761000
H 1.45424700 4.31072200 0.00011700
H 2.14403100 2.95805300 0.88734700
H 2.14426000 2.95809000 -0.88698100
1 2 1.5 5 1.0 10 1.5
2 3 1.5 13 1.5
3 4 1.5 6 1.5
4 5 1.0 9 1.5
5 14 1.0
6 7 1.5 16 1.0
7 8 1.5 17 1.0
8 9 1.5 18 1.0
9 19 1.0
10 11 1.5 20 1.0
11 12 1.5 21 1.0
12 13 1.5 22 1.0
13 23 1.0
14 15 1.0 24 1.0 25 1.0
15 26 1.0 27 1.0 28 1.0
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G4 在热力学组合方法里都是高端的存在。20多个原子左右基本已经是差不多的上限了 ,里面涉及到了MP4 以及 CCSD(T)的步骤。快是肯定不快的。慢慢等着就行。一般30核心左右的,15,6个原子左右的 可能跑上一个小时差不多。原子数目翻一倍那计算时间翻到50, 60倍差不多。40个原子 恐怕就很难算的动了。
至于cpu使用率低是因为 post-HF方法 需要大量的读取 写入硬盘。cpu在那里就是干等着的 硬盘越快 cpu的效率就越高。
原来如此,难怪卡在昨晚凌晨四点就再也不动了,非常感谢,请问前辈,像我这种大分子,有没有推荐的热力学组合方法,G3方法在现在来看是不是有些过时了?ps. 我暂时用的36核,学校服务器一般一个人最多调用72核,不然会被别的人喷
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G3确实过时了。高斯内置的方法里 G4MP2 和 CBS-QB3 性价比比较高。比G4快不少。 不过即使是这两种方法 30个原子也基本是上限了。
好的好的,谢谢前辈,我用G4MP2和CBS-QB3提交两个任务试试
如果还算不动,那就试试 G3MP2B3 这个还能再快些 但是精度也低些。CBS-4M 基本是高斯支持的方法里最快的。可以算原子数能多一点点 但是精度比前几个可要低不少了。
好的好的,非常感谢前辈,那我就再提交两个任务,我现在就是在筛选一个合适的方法