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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请问G4方法能不能算的动三四十个原子的分子
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护发专家

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问G4方法能不能算的动三四十个原子的分子已有1人参与

请问G4方法能算的动三四十个原子的分子结构吗。我看别人的文献中用G4算乙基咔唑的能量，可是我跑了15个小时了，还没有算完，目前的状态是opt结束了，后面就一直卡着没结果，实际上只算了7个小时。用的服务器，36核算的。我的输入文件如下：
# G4 geom=connectivity

necz

0 1
C                 -1.14579300    0.49395000   -0.00001300
C                 -0.96842200   -0.91454000    0.00001300
C                  0.45961100   -1.15076200    0.00000700
C                  1.10413000    0.12488100   -0.00002000
N                  0.10752000    1.12339000   -0.00002400
C                  1.21791600   -2.32663400    0.00002200
C                  2.60766900   -2.24443400    0.00000500
C                  3.23702200   -0.98827700   -0.00003000
C                  2.50542400    0.19988000   -0.00004100
C                 -2.42249000    1.06833400   -0.00002600
C                 -3.52355000    0.21048700   -0.00000800
C                 -3.36228800   -1.18688000    0.00002100
C                 -2.08817400   -1.75394600    0.00003100
C                  0.18141300    2.59551500   -0.00007000
C                  1.57214900    3.22560800    0.00011600
H                  0.72562900   -3.29068700    0.00004600
H                  3.20564100   -3.14553000    0.00001300
H                  4.31787600   -0.93431500   -0.00004600
H                  3.03074100    1.13873800   -0.00007000
H                 -2.56474100    2.13969000   -0.00005200
H                 -4.52066400    0.63070900   -0.00001900
H                 -4.23598900   -1.82446300    0.00003300
H                 -1.96889900   -2.82973300    0.00005100
H                 -0.36611100    2.95292500   -0.87792300
H                 -0.36635300    2.95297800    0.87761000
H                  1.45424700    4.31072200    0.00011700
H                  2.14403100    2.95805300    0.88734700
H                  2.14426000    2.95809000   -0.88698100

1 2 1.5 5 1.0 10 1.5
2 3 1.5 13 1.5
3 4 1.5 6 1.5
4 5 1.0 9 1.5
5 14 1.0
6 7 1.5 16 1.0
7 8 1.5 17 1.0
8 9 1.5 18 1.0
9 19 1.0
10 11 1.5 20 1.0
11 12 1.5 21 1.0
12 13 1.5 22 1.0
13 23 1.0
14 15 1.0 24 1.0 25 1.0
15 26 1.0 27 1.0 28 1.0
16
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1楼2020-06-12 11:02:12
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
护发专家: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2020-06-12 13:48:14
G4 在热力学组合方法里都是高端的存在。20多个原子左右基本已经是差不多的上限了 ，里面涉及到了MP4 以及 CCSD(T)的步骤。快是肯定不快的。慢慢等着就行。一般30核心左右的，15,6个原子左右的 可能跑上一个小时差不多。原子数目翻一倍那计算时间翻到50， 60倍差不多。40个原子 恐怕就很难算的动了。
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2楼2020-06-12 12:33:27
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

至于cpu使用率低是因为 post-HF方法 需要大量的读取 写入硬盘。cpu在那里就是干等着的 硬盘越快 cpu的效率就越高。
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3楼2020-06-12 12:34:38
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护发专家

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-12 12:33:27
G4 在热力学组合方法里都是高端的存在。20多个原子左右基本已经是差不多的上限了 ，里面涉及到了MP4 以及 CCSD(T)的步骤。快是肯定不快的。慢慢等着就行。一般30核心左右的，15,6个原子左右的 可能跑上一个小时差不 ...

原来如此，难怪卡在昨晚凌晨四点就再也不动了，非常感谢，请问前辈，像我这种大分子，有没有推荐的热力学组合方法，G3方法在现在来看是不是有些过时了？ps. 我暂时用的36核，学校服务器一般一个人最多调用72核，不然会被别的人喷、。。
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4楼2020-06-12 13:33:14
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paramecium86

版主 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 护发专家 at 2020-06-12 00:33:14
原来如此，难怪卡在昨晚凌晨四点就再也不动了，非常感谢，请问前辈，像我这种大分子，有没有推荐的热力学组合方法，G3方法在现在来看是不是有些过时了？ps. 我暂时用的36核，学校服务器一般一个人最多调用72核，不 ...

G3确实过时了。高斯内置的方法里  G4MP2 和 CBS-QB3 性价比比较高。比G4快不少。  不过即使是这两种方法 30个原子也基本是上限了。
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5楼2020-06-12 13:43:58
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护发专家

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-12 13:43:58
G3确实过时了。高斯内置的方法里  G4MP2 和 CBS-QB3 性价比比较高。比G4快不少。  不过即使是这两种方法 30个原子也基本是上限了。...

好的好的，谢谢前辈，我用G4MP2和CBS-QB3提交两个任务试试
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6楼2020-06-12 13:47:00
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paramecium86

版主 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 护发专家 at 2020-06-12 00:47:00
好的好的，谢谢前辈，我用G4MP2和CBS-QB3提交两个任务试试...

如果还算不动，那就试试 G3MP2B3 这个还能再快些 但是精度也低些。CBS-4M 基本是高斯支持的方法里最快的。可以算原子数能多一点点 但是精度比前几个可要低不少了。
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7楼2020-06-12 14:00:52
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护发专家

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-12 14:00:52
如果还算不动，那就试试 G3MP2B3 这个还能再快些 但是精度也低些。CBS-4M 基本是高斯支持的方法里最快的。可以算原子数能多一点点 但是精度比前几个可要低不少了。...

好的好的，非常感谢前辈，那我就再提交两个任务，我现在就是在筛选一个合适的方法
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8楼2020-06-12 14:27:09
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