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6楼: Originally posted by 416114799 at 2017-04-12 14:33:29
我理解会不会就是你的测序深度的意思，我们测序都会有一个测多少个的数值，所谓的阈值。不知道你是否没有画稀释度曲线图？根据图可以看出来的，就是我说的那个100%的线。OTUs跟CHAO等是有关系的，软件计算会自己给 ...

测序深度会用到“rarefy”和“rarefaction”这两个词吗？测序公司倒是给了稀释曲线，也没有100%的线

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9楼: Originally posted by 雨巷12 at 2017-04-12 15:22:53
测序深度会用到“rarefy”和“rarefaction”这两个词吗？测序公司倒是给了稀释曲线，也没有100%的线

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就是这个东西，横轴是测序数量，这个你可以问公司的，问他们一个样品测了多少个序列。这个就是100%那个线的依据。此外，你问下你图中三条线分别表示%多少相似性。从你的图来看，测序深度是足够了。你可以把这个图附上，告诉审稿人，你测序保证有20万个序列/样品，这些数据是用什么软件分析的。稀释度曲线只是一个概念，当然就是为了描述测序深度的，没有别的用途。至于OTUs，Chao等是通过软件分析的结果，也会受测序深度的影响，不过跟稀释度之间是没有关系的。

我认为第一个问题是问你：你的数据是通过什么手段进行分析的？rarefy也有精选、挑选的意思，其实就是用软件对你的数据经行统计的过程，即，稀释度分析过程；第二个问题是问你：你数据进行稀释度分析时的极限是多少，这个极限就是100%那个意思，即，测序深度（每个样品测的序列个数，稀释度曲线的X轴）。你回答问题可以谦虚点，最后加句话，说不知道我理解是否正确，还望多多指教（Please let me know if I misunderstand your comments）。

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10楼: Originally posted by 416114799 at 2017-04-12 18:42:30
就是这个东西，横轴是测序数量，这个你可以问公司的，问他们一个样品测了多少个序列。这个就是100%那个线的依据。此外，你问下你图中三条线分别表示%多少相似性。从你的图来看，测序深度是足够了。你可以把这个图附 ...

谢谢您的帮助，从您这里我学到了很多知识。文章我已经修改完成并返回了，审稿人没再提这方面的问题，开心~~~

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10楼: Originally posted by 416114799 at 2017-04-12 18:42:30
就是这个东西，横轴是测序数量，这个你可以问公司的，问他们一个样品测了多少个序列。这个就是100%那个线的依据。此外，你问下你图中三条线分别表示%多少相似性。从你的图来看，测序深度是足够了。你可以把这个图附 ...

谢谢帮助，刚刚好像没回帖成功，再回一次,我文章已经返回修改了，审稿人没有再提这方面的问题，非常感谢您的帮助！

顺利就好，祝贺