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已经在Gene bank中查找到了某个基因的序列，如何设计PVR的上下游引物呢？

作者 say-jeremy: 来源: 小木虫 350 7 举报帖子

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已经在Gene bank中查找到了某个基因的序列，如何设计PVR的上下游引物呢？
求解之谢谢谢谢返回小木虫查看更多

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say-jeremy

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Originally posted by say-jeremy at 2011-06-29 10:36:23:
已经在Gene bank中查找到了某个基因的序列，如何设计PVR的上下游引物呢？
求解之谢谢谢谢

打错了是PCR引物
iaminxanadu

PCR后做什么啊？

最简单的就是看，用眼睛看，根据那些随处可见的引物计原则。

差不多就拷贝序列的前19个左右的碱基作为上引物，序列末端后19个左右碱基的互补序列反过来写作为下引物。

根据下一步的用途

1.考虑序列是否要带原来的启动子终止子，还是只要ORF、CDS

1.考虑加入合适的酶切位点。
jinkui960

最简单、方便的引物在线设计软件Primer 3，很好用哦！

http://frodo.wi.mit.edu/primer3/
say-jeremy

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Originally posted by jinkui960 at 2011-06-29 11:24:19:
最简单、方便的引物在线设计软件Primer 3，很好用哦！

http://frodo.wi.mit.edu/primer3/

只要把序列复制粘贴一下就行吗
，
jinkui960

是的，还要设定你要扩增的目的产物有多大，引物长度、Tm值也可以根据自己的要求进行设定！
say-jeremy

引用回帖:
Originally posted by jinkui960 at 2011-06-29 12:27:48:
是的，还要设定你要扩增的目的产物有多大，引物长度、Tm值也可以根据自己的要求进行设定！

还想问一个问题那用你说的这个方法和primer premier 6 软件设计哪个更精确呢谢谢哈
jinkui960

引用回帖:
Originally posted by say-jeremy at 2011-06-29 16:28:47:
还想问一个问题那用你说的这个方法和primer premier 6 软件设计哪个更精确呢谢谢哈

没有比较过，不过一般的PCR， Primer 3足够了！