关于SYBR半定量荧光定量PCR的问题求助
我做SYBR荧光半定量PCR,没有测RNA浓度就反转录成cDNA,
后来看论坛上说要预先测RNA浓度,再取相同的RNA量做逆转录为cDAN,再以此cDNA为模板做定量PCR。
现在我没有测RNA浓度,请问做内参可以解决这个问题吗?
这样做的结果可信吗?
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我做SYBR荧光半定量PCR,没有测RNA浓度就反转录成cDNA,
后来看论坛上说要预先测RNA浓度,再取相同的RNA量做逆转录为cDAN,再以此cDNA为模板做定量PCR。
现在我没有测RNA浓度,请问做内参可以解决这个问题吗?
这样做的结果可信吗?
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我做RT-pcr就没有测过RNA浓度,各组浓度相差不大,从内参的起峰循环数就可以看出。就算差点,稀释十倍后也差不到哪去了。当然你不能让各组相差太多,确保各组内参在15个循环左右起峰最好。各组都是拿内参作比较,所以结果木有多大问题。
没有多大问题,但是如果用Delta ct法,最好要标准曲线斜率相近,就是扩增效率要一至,不然结果不可信。因为此法有几个关键假设。如果扩增效率不一至的时候,模板量接近,误差越小。正常情况,扩增效率不会完全一至,所以控制模板量接近,可以最小化误差,