【求助】重叠布局数说明了什么，从哪里看出来呢
如题，谢谢
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简单通俗地说，重叠布居的大小可以说明原子间结合力度大小，值越大，结合力越大。（当然，从布居电荷角度讲，又可利用它说明体系的微观反应活性）
那从输出文件里面那一部分是呢，又该怎么分析呢
输出文件好象在总能量(Total Eergy)的结果之后；电荷数的前面。如果体系较大，输出文件会篇幅很大，那就要弄清原子编号，然后对应地自己找到您想知道的两个原子间的布居数。
把你的输出文件中关于“population”的部分给出来，对应着跟您将比较好。我最近不常上木虫，您也不需给我金币。
Natural Bond Orbitals (Summary):
Principal Delocalizations
NBO Occupancy Energy (geminal,vicinal,remote)
====================================================================================
Molecular unit 1 (C4H6F3OPPt)
1. BD ( 1)Pt 1 - C 2 1.95484 -0.34522 33(v),144(g),145(g),56(g)
149(v),150(v),156(v),154(v)
70(v)
2. BD ( 1)Pt 1 - P 9 1.99128 -0.48435 33(r),144(g),155(g),145(g)
154(g),156(g)
3. BD ( 1) C 2 - C 3 1.98307 -0.70534 33(g),145(v),144(g),153(v)
149(g),75(v),150(g),147(g)
148(g)
4. BD ( 1) C 2 - H 6 1.98654 -0.53930 149(v),144(g),68(v),145(v)
146(g),66(v)
5. BD ( 1) C 2 - H 7 1.98613 -0.53433 150(v),67(v),145(v),144(g)
146(g)
6. BD ( 1) C 3 - C 4 1.98195 -0.68924 145(r),33(g),146(g),147(v)
151(g),158(v),108(v),57(v)
84(v),150(g)
7. BD ( 1) C 3 - H 8 1.97517 -0.54094 145(r),151(v),33(g),148(v)
146(g),57(v),76(v),152(v)
8. BD ( 1) C 4 - O 5 1.99550 -1.09403 149(g),75(g),150(v)
9. BD ( 2) C 4 - O 5 1.97280 -0.38856 33(v),159(v),157(v)
10. BD ( 1) C 4 - C 13 1.98836 -0.68047 146(v),66(v),84(v)
11. BD ( 1) P 9 - H 10 1.99432 -0.49621 156(g),155(g)
12. BD ( 1) P 9 - H 11 1.99269 -0.49666 144(v),154(g),156(g)
13. BD ( 1) P 9 - H 12 1.99439 -0.49614 154(g),155(g)
14. BD ( 1) C 13 - F 14 1.99375 -1.03478 159(g),158(g),109(g),152(v)
151(v)
15. BD ( 1) C 13 - F 15 1.99480 -1.06335 149(v),157(g),159(g),108(g)
110(g)
16. BD ( 1) C 13 - F 16 1.99346 -1.03420 157(g),152(v),158(g),109(g)
17. CR ( 1)Pt 1 1.99819 -3.82240 33(r),144(g),145(g),156(v)
154(v),155(v)
18. CR ( 2)Pt 1 1.99812 -2.10516 33(r),145(g)
19. CR ( 3)Pt 1 1.99544 -2.10450 144(g),33(r)
20. CR ( 4)Pt 1 1.99874 -2.09322 33(r)
21. CR ( 1) C 2 1.99916 -10.08796 66(v),144(g),33(v),145(v)
94(v),93(v),149(v),150(v)
146(g)
22. CR ( 1) C 3 1.99898 -10.07579 33(g),145(r),59(v),76(v)
95(v),151(v),146(g)
23. CR ( 1) C 4 1.99899 -10.16979 110(v),68(v)
24. CR ( 1) O 5 1.99972 -18.88436 75(v),149(v)
25. CR ( 1) C 13 1.99916 -10.34991 153(g),76(v),159(g),157(g)
158(g)
26. CR ( 1) F 14 1.99990 -24.44636 109(v),108(v),110(v)
27. CR ( 1) F 15 1.99990 -24.44090 108(v),110(v)
27. CR ( 1) F 15 1.99990 -24.44090 108(v),110(v)
28. CR ( 1) F 16 1.99990 -24.44810 109(v),108(v),110(v)
29. LP ( 1)Pt 1 1.99524 -0.23895 33(r)
30. LP ( 2)Pt 1 1.98503 -0.24219 33(r),97(v),98(v),104(v)
100(v),101(v),156(v),144(g)
67(r),52(g),99(v),55(g)
102(v),154(v)
31. LP ( 3)Pt 1 1.95133 -0.26678 33(r),155(v),97(v),101(v)
100(v),99(v),104(v),144(g)
58(v),52(g),55(g),50(g)
46(g),67(r),102(v)
32. LP ( 4)Pt 1 1.92029 -0.25704 154(v),156(v),33(r),96(v)
152(r),150(r),149(r),147(v)
148(v)
33. LP ( 1) C 3 1.14344 -0.19163 144(v),145(r),152(v),146(g)
58(v),56(r),147(v),148(v)
103(r),67(g),77(v)
34. LP ( 1) O 5 1.97929 -0.69146 75(v),149(v),153(v)
35. LP ( 2) O 5 1.87511 -0.26964 153(v),149(v),78(v),77(v)
76(v),33(r),157(r)
36. LP ( 1) F 14 1.98879 -1.07055 109(v),108(v),110(v),111(v)
37. LP ( 2) F 14 1.94567 -0.42673 153(v),158(v),159(v),110(v)
152(r),112(v)
38. LP ( 3) F 14 1.93147 -0.42550 159(v),158(v),108(v),113(v)
39. LP ( 1) F 15 1.98876 -1.05465 108(v),110(v),111(v)
40. LP ( 2) F 15 1.94219 -0.42228 153(v),157(v),159(v),110(v)
114(v),149(r),113(v)
41. LP ( 3) F 15 1.92498 -0.42238 159(v),157(v),109(v),112(v)
42. LP ( 1) F 16 1.98747 -1.07037 109(v),108(v),110(v)
43. LP ( 2) F 16 1.94265 -0.42581 153(v),158(v),157(v),152(r)
110(v),112(v)
44. LP ( 3) F 16 1.93172 -0.42498 157(v),158(v),108(v),113(v)
45. RY*( 1)Pt 1 0.00247 0.40047
46. RY*( 2)Pt 1 0.00160 0.98258
47. RY*( 3)Pt 1 0.00137 0.41152
48. RY*( 4)Pt 1 0.00095 0.52569
49. RY*( 5)Pt 1 0.00072 0.48012
50. RY*( 6)Pt 1 0.00053 0.56942
51. RY*( 7)Pt 1 0.00044 0.55326
52. RY*( 8)Pt 1 0.00041 1.36888
53. RY*( 9)Pt 1 0.00019 0.47612
54. RY*( 10)Pt 1 0.00019 0.54174
55. RY*( 11)Pt 1 0.00010 1.13597
56. RY*( 12)Pt 1 0.00004 3.24097
57. RY*( 1) C 2 0.00449 1.03403
58. RY*( 2) C 2 0.00325 0.79435
59. RY*( 3) C 2 0.00116 0.69650
60. RY*( 4) C 2 0.00066 1.80186
61. RY*( 5) C 2 0.00033 1.71027
62. RY*( 6) C 2 0.00012 1.05041
63. RY*( 7) C 2 0.00006 2.06429
64. RY*( 8) C 2 0.00005 1.93397
65. RY*( 9) C 2 0.00002 2.06653
......
144. BD*( 1)Pt 1 - C 2 0.46026 -0.07801 33(v),145(g),56(g),58(g)
59(g),47(g),155(v),67(v)
146(g),45(g)
145. BD*( 1)Pt 1 - P 9 0.32677 0.08113 33(r),56(g),144(g),97(g)
104(g),98(g),103(g),54(g)
100(g),101(g),53(g),47(g)
45(g),51(g),99(g),49(g)
146. BD*( 1) C 2 - C 3 0.01154 0.50192
147. BD*( 1) C 2 - H 6 0.01081 0.46869
148. BD*( 1) C 2 - H 7 0.01467 0.47416
149. BD*( 1) C 3 - C 4 0.06388 0.43418
150. BD*( 1) C 3 - H 8 0.01782 0.47134
151. BD*( 1) C 4 - O 5 0.01203 0.59687
152. BD*( 2) C 4 - O 5 0.15861 0.00266 33(v),159(v),157(v),80(g)
85(g)
153. BD*( 1) C 4 - C 13 0.11779 0.31890 111(g),79(g),150(v),76(g)
146(v)
154. BD*( 1) P 9 - H 10 0.03944 0.24645
155. BD*( 1) P 9 - H 11 0.04083 0.24490
156. BD*( 1) P 9 - H 12 0.03908 0.24571
157. BD*( 1) C 13 - F 14 0.10633 0.21231 109(g),152(v),115(g),159(g)
这都是什么意思呢，
这个应该不是普通选项的“population analysis”的部分，你做了全自然轨道总密度（布居）分析，更准确地说应该是“完全的自然键轨道分析”。输出部分简单地看，所有的BD算出的第一个数字应该是原子间键的布居数，后面的可能分别是与该原子配对的、邻近的和弱作用力的轨道能量吧。我不清楚您做计算的目的，如果只是想知道微观例子间作用力或电荷密度，做NBO似乎没太多必要，做一个常规的population分析可能结果还好解析一些。
另外，我有相当一段时间没用Gaussian了，我的意见只能做参考，您可能需要多看您自己领域里的文献，特别是国外文献中有的附件部分（不会出现在文章中，但在刊物网站上找得到），可能会阐述细节。
Population analysis using the SCF density.
**********************************************************************
Orbital symmetries:
Occupied (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
Virtual (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A)
The electronic state is 1-A.
Alpha occ. eigenvalues -- -3.07502 -1.89558 -1.89108 -1.84306 -0.73178
Alpha occ. eigenvalues -- -0.67547 -0.67168 -0.41982 -0.41498 -0.41403
Alpha occ. eigenvalues -- -0.41284 -0.38628 -0.32313 -0.32292 -0.28156
Alpha occ. eigenvalues -- -0.28045 -0.22906 -0.22514 -0.19750 -0.18774
Alpha virt. eigenvalues -- -0.10058 -0.01571 -0.00496 0.00175 0.03679
Alpha virt. eigenvalues -- 0.04089 0.04320 0.04870 0.05728 0.12519
Alpha virt. eigenvalues -- 0.14648 0.17367 0.18346 0.24597 0.32794
Alpha virt. eigenvalues -- 0.34681 0.35365 0.36877 0.37029 0.37526
Alpha virt. eigenvalues -- 0.39747 0.40176 0.41842 0.42984 0.44009
Alpha virt. eigenvalues -- 0.48428 0.54138 0.55755 0.57476 0.59109
Alpha virt. eigenvalues -- 0.60811 0.61055 0.61990 0.70763 0.73115
Alpha virt. eigenvalues -- 0.73262 0.73939 0.76536 0.82318 0.84438
Alpha virt. eigenvalues -- 0.87341 0.88660 0.91677 0.96358 0.96680
Alpha virt. eigenvalues -- 1.12107 1.12214 1.13618 1.14705 3.07854
Alpha virt. eigenvalues -- 8.80442 11.99276 14.35468
Condensed to atoms (all electrons):
1 2 3 4 5 6
1 Rh 16.500493 0.205139 0.161879 -0.009434 -0.009336 -0.005503
2 Cl 0.205139 7.126911 -0.001735 -0.001039 -0.001010 0.000324
3 P 0.161879 -0.001735 4.072983 0.353886 0.353647 0.335792
4 H -0.009434 -0.001039 0.353886 0.544565 -0.019881 -0.016786
5 H -0.009336 -0.001010 0.353647 -0.019881 0.545180 -0.016814
6 H -0.005503 0.000324 0.335792 -0.016786 -0.016814 0.593185
7 P 0.161918 -0.001746 -0.023018 0.000057 0.000057 0.000055
8 H -0.005500 0.000326 0.000055 0.000000 0.000000 0.000000
9 H -0.009340 -0.001013 0.000057 0.000000 -0.000001 0.000000
10 H -0.009440 -0.001045 0.000057 -0.000001 0.000000 0.000000
7 8 9 10
1 Rh 0.161918 -0.005500 -0.009340 -0.009440
2 Cl -0.001746 0.000326 -0.001013 -0.001045
3 P -0.023018 0.000055 0.000057 0.000057
4 H 0.000057 0.000000 0.000000 -0.000001
5 H 0.000057 0.000000 -0.000001 0.000000
6 H 0.000055 0.000000 0.000000 0.000000
7 P 4.072870 0.335764 0.353659 0.353893
8 H 0.335764 0.593232 -0.016813 -0.016782
9 H 0.353659 -0.016813 0.545165 -0.019881
10 H 0.353893 -0.016782 -0.019881 0.544523
那这个是不是普通的分析
我是在论文中看到有人做布局分析来确定是否成键，以及成键的程度，分析成键的时候大部分是这样说的“1与2的键逐渐形成，布局数增加”
举一个论文上的例子
是各个中间态的成键的重叠布局数。原子Co跟C之间的
R1 TS1-2 R2 R3 TS3-4 R4
Co-C ~ ~ 0.0945 0.1463 0.3159 0.1216
我想知道的就是这几个数据到底是输出文件的哪些个呢？？？