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吕素娟

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因突变分析样本选择DNA还是RNA 已有1人参与

我看一般都是选择提取DNA进行PCR,然后测序的,我做的是慢性粒细胞白血病 耐药相关基因突变,文献都是提取的RNA,然后逆转录为cDNA,然后再PCR扩增测序。然后就想弱弱问下为什么有些是DNA有些是RNA,怎么选择呢,谢谢!!
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董博士

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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测序就是用DNA,之所以要提取RNA是因为要获得你所说的相关基因,然后通过反转为cDNA,然后以其为模板得到目的基因的DNA,而如果你要直接提取DNA的话是全基因组DNA,范围很大,就不只是你的目的基因了
医学&统计学
2楼2015-07-04 09:41:07
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吕素娟

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 董博士 at 2015-07-04 09:41:07
测序就是用DNA,之所以要提取RNA是因为要获得你所说的相关基因,然后通过反转为cDNA,然后以其为模板得到目的基因的DNA,而如果你要直接提取DNA的话是全基因组DNA,范围很大,就不只是你的目的基因了

一般提取了DNA还是要用特定引物扩增我们的目的基因啊 ,也不会拿基因组DNA去测序啊
3楼2015-07-10 00:18:20
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董博士

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 吕素娟 at 2015-07-10 00:18:20
一般提取了DNA还是要用特定引物扩增我们的目的基因啊 ,也不会拿基因组DNA去测序啊...

是用目的基因测序啊,你说的“为什么有些是DNA有些是RNA,怎么选择呢”,你所说的选择是什么意思啊
医学&统计学
4楼2015-07-10 14:44:59
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吕素娟

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 董博士 at 2015-07-10 14:44:59
是用目的基因测序啊,你说的“为什么有些是DNA有些是RNA,怎么选择呢”,你所说的选择是什么意思啊...

就是做突变相关实验的时候,有人要收集病人的RNA,有人要收集DNA,但最后都是通过PCR扩增某一段特定的片段去测序,基因突变应该是通过转录翻译之后发挥作用的啊,那是不是测目的基因的所有序列和测外显子序列结果是一样的啊 我的意思是在最开始,怎么选择是提取病人血液中的DNA还是RNA,谢谢!!!
5楼2015-07-11 16:15:17
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