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想请问一下DH5α和K-12之间的关系 已有3人参与
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新手自己做微生物 想请教一下我们一般用的DH5α是K-12菌株改造过来吗？它的Genome和我在NCBI上搜索的K-12的Genome有什么不同吗？我可不可以直接用NCBI上的序列对DH5α的细菌做菌落PCR？谢谢咯 |
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... 首先， 是K-12而非K12， 后者是表面多糖的一种鉴别方式， 有着本质上的区别 K-12应该是在上个世纪40年Tatum开始用来做基因学研究才开始收到广泛使用的，菌株由斯丹佛大学的科研人员管理， 中间有过菌株混谣的问题。 最原始的， 由1922年分离的菌株早已经不知道什么时候就丢失了， MG1655被认为是离原始菌株最相近的菌株。 所有从原始的K-12变化出来的菌株都是K-12, 包括MG1655， DH5alpha, DH10beta, MC4100, W3110等， 或可多达上百种常用菌。 我念博士的实验室就有多达9000株菌， 其中6000株严格来讲都可以算是K-12. |
3楼2015-06-14 13:30:27
RuyangHan
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还是应该在GenBank比对一下，看看你的目的基因是否缺失或引物结合位点是否匹配。以上两点确认后，菌落PCR应该没问题。 K12是野生菌株。 DH5α的遗传型 F- λ– endA1 glnV44 thi-1 recA1 relA1 gyrA96 deoR nupG Φ80dlacZΔM15 Δ(lacZYA-argF)U169, hsdR17(rK- mK+) 菌株遗传性状查询可通过下列网站： http://cgsc.biology.yale.edu/ |
2楼2015-06-13 12:27:45
602059625
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the DH5α genome is not publicly available 其他k12的基因组（MG1655、W3110）可作参考，一些内切酶、重组酶、转座子什么的可能会有不同  Highly accurate genome sequences of Escherichia coli K-12 strains MG1655 and W3110 Laboratory strains of Escherichia col：model citizens or deceitful delinquents growing old disgracefully Lineage: strain 1100 (Hoffman-Berling) --> MM294 (Meselson) --> DH1 (Hanahan) --> DH5 (Hanahan). Douglas Hanahan , personal communication  Endonuclease I-deficient and ribonuclease I-deficient Escherichia coli mutants  w208.PNG Pedigrees of some mutant strains of Escherichia coli K-12 http://openwetware.org/wiki/E._coli_genotypes#DH1 |
4楼2015-06-14 16:08:19