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我L小狼

新虫 (初入文坛)

[交流] 想请问一下DH5α和K-12之间的关系 已有3人参与

新手自己做微生物
想请教一下我们一般用的DH5α是K-12菌株改造过来吗?它的Genome和我在NCBI上搜索的K-12的Genome有什么不同吗?我可不可以直接用NCBI上的序列对DH5α的细菌做菌落PCR?谢谢咯
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RuyangHan

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
还是应该在GenBank比对一下,看看你的目的基因是否缺失或引物结合位点是否匹配。以上两点确认后,菌落PCR应该没问题。
K12是野生菌株。
DH5α的遗传型  F- λ– endA1 glnV44 thi-1 recA1 relA1 gyrA96 deoR nupG Φ80dlacZΔM15 Δ(lacZYA-argF)U169, hsdR17(rK- mK+)

菌株遗传性状查询可通过下列网站:
http://cgsc.biology.yale.edu/
2楼2015-06-13 12:27:45
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fenghan06

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by RuyangHan at 2015-06-13 12:27:45
还是应该在GenBank比对一下,看看你的目的基因是否缺失或引物结合位点是否匹配。以上两点确认后,菌落PCR应该没问题。
K12是野生菌株。
DH5α的遗传型  F- λ– endA1 glnV44 thi-1 recA1 relA1 gyrA96 deoR nupG ...

...

首先, 是K-12而非K12, 后者是表面多糖的一种鉴别方式, 有着本质上的区别

K-12应该是在上个世纪40年Tatum开始用来做基因学研究才开始收到广泛使用的,菌株由斯丹佛大学的科研人员管理, 中间有过菌株混谣的问题。 最原始的, 由1922年分离的菌株早已经不知道什么时候就丢失了, MG1655被认为是离原始菌株最相近的菌株。

所有从原始的K-12变化出来的菌株都是K-12, 包括MG1655, DH5alpha, DH10beta, MC4100, W3110等, 或可多达上百种常用菌。 我念博士的实验室就有多达9000株菌, 其中6000株严格来讲都可以算是K-12.
3楼2015-06-14 13:30:27
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602059625

金虫 (知名作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
the DH5α genome is not publicly available
其他k12的基因组(MG1655、W3110)可作参考,一些内切酶、重组酶、转座子什么的可能会有不同
想请问一下DH5α和K-12之间的关系
Highly accurate genome sequences of Escherichia coli K-12 strains MG1655 and W3110
Laboratory strains of Escherichia col:model citizens or deceitful delinquents growing old disgracefully
Lineage: strain 1100 (Hoffman-Berling) --> MM294 (Meselson) --> DH1 (Hanahan) --> DH5 (Hanahan). Douglas Hanahan , personal communication
想请问一下DH5α和K-12之间的关系-1
Endonuclease I-deficient and ribonuclease I-deficient Escherichia coli mutants
想请问一下DH5α和K-12之间的关系-2
w208.PNG
Pedigrees of some mutant strains of Escherichia coli K-12
http://openwetware.org/wiki/E._coli_genotypes#DH1
[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=填写姓名&say=这里填写您想说的内容。[/img][/url]
4楼2015-06-14 16:08:19
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