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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » DGGE的替代实验，急急急！！！！！！！！
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summer_zhao

银虫 (初入文坛)

[求助] DGGE的替代实验，急急急！！！！！！！！已有6人参与

我是口腔医学专业的研究生二年级学生，最近刚开始准备做实验（有点晚。。。），我需要检测龈下微生物中优势菌在治疗前后的构成比例变化，查文献查到说可以做DGGE，但是学校实验室没有DGGE电泳仪，而且听说DGGE不好做，我对微生物检测方面实在是知之甚少，所以想请问微生物方面的大神，有没有更适合我的实验方法，最好能用时短点，毕业之前出不来结果就惨了啊。
请大神们不吝赐教，拜托拜托了
非常感谢！
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1楼2015-05-29 10:37:30
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

RuyangHan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by miito at 2015-05-29 17:22:45
您好，请问高通量测序的价格大约是多少
...

一般500-1000元/样品。可以具体问一下公司。有了高通量数据，DGGE就过时了。
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2015-05-29 23:17:14
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RuyangHan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励新虫 2015-05-29 21:40:55
提了DNA后，直接送公司做16S 序列高通量测序，然后后他们做深度分析。你根据他们的结果学论文。
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4楼2015-05-29 14:03:50
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RuyangHan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by summer_zhao at 2015-06-02 00:12:13
高通量测序能测出经过处理后某种菌在几个时间点上的数量变化趋势吗...

可以的，你可以从测序后得到的分类数据中获得某个菌群的序列数。但是要注意测序的是PCR产物，所以扩增后不同菌群的比列可能和原来DNA样品有所不同，导致误差。而且无法绝对定量，得出的结果以菌群之间的比值的变化做相对比较。假如需要绝对定量，可考虑定量PCR。
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11楼2015-06-02 14:50:52
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普通回帖

biolinker

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以做高通量测序，还是比较快的。
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summer_zhao
2楼2015-05-29 11:31:25
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summer_zhao

银虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by biolinker at 2015-05-29 11:31:25
可以做高通量测序，还是比较快的。

谢谢！
那高通量测序能做相对定量分析吗？需要用什么专用的仪器吗
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3楼2015-05-29 12:54:11
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miito

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by RuyangHan at 2015-05-29 14:03:50
提了DNA后，直接送公司做16S 序列高通量测序，然后后他们做深度分析。你根据他们的结果学论文。

您好，请问高通量测序的价格大约是多少

[ 发自小木虫客户端 ]
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5楼2015-05-29 17:22:45
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小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪
引用回帖:
5楼: Originally posted by miito at 2015-05-29 17:22:45
您好，请问高通量测序的价格大约是多少
...

这个大约7.8k左右  另外包括DGGE也可以帮你代做
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生命还需要奇迹来衬托
6楼2015-05-29 18:19:01
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summer_zhao

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 小小逍遥人 at 2015-05-29 18:19:01
这个大约7.8k左右  另外包括DGGE也可以帮你代做...

费用是怎么算的
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7楼2015-05-29 22:10:24
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海帅10000

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可能只有做高通量了，不做DGGE，好像DGGE比高通量还要贵些！上海有个“微基”做微生物多样性不错。
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9楼2015-06-01 13:27:10
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summer_zhao

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by RuyangHan at 2015-05-29 23:17:14
一般500-1000元/样品。可以具体问一下公司。有了高通量数据，DGGE就过时了。...

高通量测序能测出经过处理后某种菌在几个时间点上的数量变化趋势吗
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10楼2015-06-02 00:12:13
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