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生物蚂蚁

新虫 (初入文坛)

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[求助] 批量修改序列名字已有2人参与

各位，好！
我想批量修改序列的名字，请问应该怎么做，最好使用perl。序列名字大体如下：
>Mt3708298.1 Afjjgjgkkfjgorgjo
AAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTT

>Mt3708398.1 bvykyjgdjspskgjs
CGATGCGCGCGCGAATATATAGCGTAGACTAGATC

我想改成：
>Mt3708298.1
>Mt3708398.1
也就是说，只要序列名字的前几位，应该怎么写脚本呢？谢谢！

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1楼 2015-05-20 12:15:33

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liuderong

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【答案】应助回帖

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wizardfan: 金币+2, thanks for helping, but there is an error in your codes 2015-05-21 08:06:12
wizardfan: sorry, no error. my mistake, forget that you do not chomp 2015-05-21 08:08:14
生物蚂蚁: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2015-05-23 11:03:16

#!/usr/bin/perl -w
open IN,"....";#"...."位置换成初始文件的路径
open OUT,"...";#"..."位置换成你想保存结果的文件路径
while(<IN>