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我是小李飞刀

新虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质结构预测和建模 已有2人参与

万能的虫友们大家好!

想做一个短肽的三级结构模型。Swiss Modle 只能针对大于30个氨基酸残基的蛋白质,请问虫友们有知道如何对短肽进行建模么,用的是哪个软件?我的短肽只有18个氨基酸残基。

谢谢啦!在线等!
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
我是小李飞刀: 金币+2, ★★★很有帮助, 是的,文献大部分也都是圆二色谱测一下。 2015-05-13 18:30:14
由于短肽序列太多,很难有稳定的三级结构,一般就二级结构
4楼2015-05-13 16:26:24
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
我是小李飞刀: 金币+3, ★★★很有帮助, 好的,我试一下。谢啦! 2015-05-13 18:29:09
小肽结构预测没做过,一般教程中推荐的是HMMSTR、ROSSETA两种工具,你可以试下。
3楼2015-05-13 15:47:39
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