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我是小李飞刀

新虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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散金: 3
帖子: 51
在线: 41.5小时
虫号: 2113144
注册: 2012-11-07
专业: 作物分子育种

[求助] 蛋白质结构预测和建模已有2人参与

万能的虫友们大家好！

想做一个短肽的三级结构模型。Swiss Modle 只能针对大于30个氨基酸残基的蛋白质，请问虫友们有知道如何对短肽进行建模么，用的是哪个软件？我的短肽只有18个氨基酸残基。

谢谢啦！在线等！

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1楼 2015-05-13 12:01:46

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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

MolEPI: 58
应助: 388 (硕士)
贵宾: 0.238
金币: 17138.7
红花: 43
帖子: 2251
在线: 712.4小时
虫号: 111074
注册: 2005-11-20
专业: 生物化学

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
我是小李飞刀: 金币+2, ★★★很有帮助, 是的，文献大部分也都是圆二色谱测一下。 2015-05-13 18:30:14

由于短肽序列太多，很难有稳定的三级结构，一般就二级结构

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4楼2015-05-13 16:26:24

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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

MolEPI: 2
应助: 682 (博士)
金币: 6507
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红花: 95
帖子: 1559
在线: 801.6小时
虫号: 1427240
注册: 2011-10-04
性别: GG
专业: 植物生理与生化

【答案】应助回帖

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我是小李飞刀: 金币+3, ★★★很有帮助, 好的，我试一下。谢啦！ 2015-05-13 18:29:09

小肽结构预测没做过，一般教程中推荐的是HMMSTR、ROSSETA两种工具，你可以试下。

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3楼2015-05-13 15:47:39

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我是小李飞刀

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stone2239

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