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蛋白螺旋

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】除了swiss-model还有别的预测基因蛋白三维结构的工具吗? 已有6人参与

如题,我克隆得到一个基因,将编码区氨基酸序列输入SWISS-MODEL预测后得到的结果只有72个氨基酸的结构(一共249个氨基酸),请教大家是不是库里没有相似的基因结构,这种情况如何预测三级结构呢?(附件里是SWISS-MODELO给出的结果,PDF格式的)
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蛋白螺旋

新虫 (初入文坛)

请教高人!!在线等结论
2楼2011-01-27 10:32:38
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励分享~~~ 2011-01-27 16:24:48
推荐你一篇文献:

protein structure prediction on the Web: a case study using the Phyre server.
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2011-01-27 15:18:07
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蛋白螺旋

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-01-27 15:18:07:
推荐你一篇文献:

protein structure prediction on the Web: a case study using the Phyre server.

Thank you
4楼2011-01-27 15:35:56
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bamboosity

木虫 (著名写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-27 16:49:01
这种情况可以采取同源建模的方法,首先你必须找到与你的基因对应氨基酸序列相似的序列(可以去美国生物信息中心National Center for Biotechnology Information数据库找),找到序列之后再进行比对建模,软件可以用MODEL,SYBYL,Discovery studio等软件。Good Luck!

[ Last edited by bamboosity on 2011-1-27 at 16:41 ]
5楼2011-01-27 16:40:43
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ghs25372216

禁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

6楼2012-05-18 21:30:00
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ghs25372216

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

7楼2012-05-18 21:30:20
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JAYWEN书生

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by brightfuture01 at 2011-01-27 15:18:07
推荐你一篇文献:

protein structure prediction on the Web: a case study using the Phyre server.

该文章下不了
8楼2013-06-06 10:09:04
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昆虫霸霸

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by JAYWEN书生 at 2013-06-06 10:09:04
该文章下不了...

我可以下,这篇文献不错,谢谢推荐!

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  • 附件 1 : Protein_structure_prediction.pdf
  • 2015-12-12 15:33:12, 669.39 K
实验加油!
9楼2015-12-12 15:33:22
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