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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】除了swiss-model还有别的预测基因蛋白三维结构的工具吗？
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蛋白螺旋

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】除了swiss-model还有别的预测基因蛋白三维结构的工具吗？ 已有6人参与

如题，我克隆得到一个基因，将编码区氨基酸序列输入SWISS-MODEL预测后得到的结果只有72个氨基酸的结构（一共249个氨基酸），请教大家是不是库里没有相似的基因结构，这种情况如何预测三级结构呢？（附件里是SWISS-MODELO给出的结果，PDF格式的）
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1楼 2011-01-26 08:55:42
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bamboosity

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-27 16:49:01
这种情况可以采取同源建模的方法，首先你必须找到与你的基因对应氨基酸序列相似的序列（可以去美国生物信息中心National Center for Biotechnology Information数据库找），找到序列之后再进行比对建模，软件可以用MODEL，SYBYL，Discovery studio等软件。Good Luck!

[ Last edited by bamboosity on 2011-1-27 at 16:41 ]
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2011-01-27 16:40:43
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蛋白螺旋

新虫 (初入文坛)
请教高人！！在线等结论
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2楼2011-01-27 10:32:38
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励分享~~~ 2011-01-27 16:24:48
推荐你一篇文献：

protein structure prediction on the Web： a case study using the Phyre server.
赞一下(2人) 回复此楼
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2011-01-27 15:18:07
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蛋白螺旋

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-01-27 15:18:07:
推荐你一篇文献：

protein structure prediction on the Web： a case study using the Phyre server.

Thank you
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4楼2011-01-27 15:35:56
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