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PCR产品变性聚丙烯酰胺凝胶电泳难题
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杜仲谷
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PCR产品变性聚丙烯酰胺凝胶电泳难题
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6 %变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,溴酚蓝的位置跑到那就不往下跑了,被压缩成了一条线,什么原因呢?请大家帮忙看一下,谢谢了!
补充;PCR产品约150bp ,溴酚蓝每次到那就不跑了,并且会被压缩。聚丙烯酰胺浓度为6%,尿素浓度为6mol/L, 电泳时候电压150V,电泳1小时20分钟,胶的长为20Cm。电场强度为7.5v/Cm。
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2015-05-05 14:03:24
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loading buffer的配方为:
98%的去离子甲酰胺4.9mL
0.5moI/L 的EDTA(PH8.0)0.1ml
溴酚蓝固体0.0125g
二甲苯青FF0.0125g
最终配成:
溴酚蓝浓度约为0.25 %
二甲苯青FF浓度约为0.25%
有论坛指出是溴酚蓝和二甲苯青的问题,请问是这样吗?
我的溴酚蓝和二甲苯青固体确实是很老很久了,配好以后也没有用滤膜过滤
请问是这个原因吗?
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从事分生的药学生
2楼
2015-05-05 14:43:27
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杜仲谷: 金币+1
2015-05-06 11:45:03
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。
2015-05-06 13:10:07
对你的目的条带有影响吗?你可以染色一下看看啊
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3楼
2015-05-05 15:34:46
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
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2015-05-06 11:45:18
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。
2015-05-06 13:10:14
为什么不用琼脂糖凝胶电泳跑胶。。。。
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todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
4楼
2015-05-05 15:56:28
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3楼
:
Originally posted by
晞朔
at 2015-05-05 15:34:46
对你的目的条带有影响吗?你可以染色一下看看啊
谢谢您的回复。
染色以后,原本150bp的PCR产物,竟然也跑到了这条“压缩带”。这说明似乎是什么原因阻碍了溴酚蓝带继续前进,到后续的条带仍然在动。
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从事分生的药学生
5楼
2015-05-06 06:32:29
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at 2015-05-05 15:56:28
为什么不用琼脂糖凝胶电泳跑胶。。。。
也 谢谢您的回复,因为琼脂糖的分辨率还达不到区分仅有3,4个碱基差异的能力。
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从事分生的药学生
6楼
2015-05-06 06:33:52
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