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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 怎么查找酶切位点
汕头大学海洋科学接受调剂
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惊叹号

金虫 (正式写手)

[求助] 怎么查找酶切位点 已有2人参与

目前实验室得到了一个pAAV/HBV1.2的质粒，需要做鉴定，按照别人参考文献给的图谱，酶切没有成功，老板要求在HBV序列nt.1400--nt.1989之间找一个酶切位点，然后进行单酶切，可是本人确实不知道怎么去查找这个酶切位点，麻烦各位大牛帮帮忙啊
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1楼 2015-04-23 09:29:45
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
惊叹号: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-04-23 14:12:36
有序列的话，用DNAMAN、BioEdit等软件可很方便的分析序列中的酶切位点分布情况。
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2楼2015-04-23 10:54:35
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惊叹号

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-04-23 10:54:35
有序列的话，用DNAMAN、BioEdit等软件可很方便的分析序列中的酶切位点分布情况。

primer5软件分析的怎么样？
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3楼2015-04-23 14:13:03
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
惊叹号: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-04-23 21:18:54
引用回帖:
3楼: Originally posted by 惊叹号 at 2015-04-23 14:13:03
primer5软件分析的怎么样？...

这个也可以，其实分析酶切位点的操作很简单，就是在序列中查找符合限制酶识别序列的位置，常规生物信息学软件都能做。或者用在线的NEBcutter（http://nc2.neb.com/NEBcutter2/）或SMS（http://www.91bio.com/SMS2/rest_summary.html）都能完成酶切位点分析。
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4楼2015-04-23 15:16:53
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maila
5楼2015-04-25 12:48:04
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hzhenzhen

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
惊叹号: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-04-28 09:33:45
snapgene挺好用的

[ 发自小木虫客户端 ]
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好好啊好
6楼2015-04-28 06:58:11
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