24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1529  |  回复: 4

chemi22

新虫 (初入文坛)

[求助] 扩基因全长出现问题了,求大神指导!!! 已有3人参与

我最近在扩基因全长,核心序列已经扩出,再扩3‘和5’端,在扩出3‘端之后,发现3’端基因序列和核心序列能拼接上,并且已扩出poly A,但是在寻找开放阅读框的时候找不到终止密码子,不知道问题出在了哪里,请大神赐教,跪谢!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可能有突变,换个样重新测序下。
2楼2015-04-09 16:25:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
要多测几个样,找到准确序列,再找ORF,可以用ORF Finder 在线软件查找
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
没有做不到,只有想不到!
3楼2015-04-09 16:30:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chemi22: 金币+1, 有帮助 2015-04-10 15:58:26
3‘和5’拼接完没问题后用核酸序列和预估的氨基酸序列都在NCBI上比对,看看起始和终止密码子有没有。找不到ORF可能有单点的碱基突变或缺失之类的问题。最后都不行就只能再设计范围大一点的引物P出来整个序列测序了。
4楼2015-04-09 19:11:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Gloria36

新虫 (初入文坛)

你好,我最近要做扩基因的全长。
我研究的菌株有亚硝酸盐还原酶,经老板送去全基因测序后预测到编码该酶的多个基因片段。
我刚结束每个预测片段的设计引物,提取菌株DNA为模板的PCR,测序后对比,验证是否与预测的序列一致。
结果是各实验得片段序列与预测序列一致。
老板现在想要我根据已知片段扩出该酶的基因全序列。
请问,我要怎么做?谢谢
5楼2017-02-28 15:38:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chemi22 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085410 273求调剂 +9 X1999 2026-04-09 9/450 2026-04-12 00:46 by 丛麟ll
[考研] 331求调剂 +5 王国帅 2026-04-11 5/250 2026-04-11 22:56 by 溪涧流水
[考研] 求调剂 +11 月@163.com 2026-04-07 13/650 2026-04-11 22:55 by BruceLiu320
[考研] 电子信息270求调剂 +14 terminal469 2026-04-07 14/700 2026-04-11 19:44 by laoshidan
[考研] 347求调剂 +3 mhyqyy 2026-04-06 3/150 2026-04-11 12:19 by zhq0425
[考研] 材料与化工调剂 +12 否极泰来2026 2026-04-10 13/650 2026-04-11 00:28 by wangjihu
[考研] 调剂 +19 小张ZA 2026-04-10 20/1000 2026-04-10 22:08 by 猪会飞
[考研] 中科院总分315求调剂 +8 lallalh 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:30 by dick_runner
[考研] 287求调剂 +15 Fnhc 2026-04-07 21/1050 2026-04-10 19:09 by chemisry
[考研] 344求调剂 +7 丶风雪夜归人丶 2026-04-09 7/350 2026-04-10 12:05 by pengliang8036
[考研] 调剂 +19 不逢春 2026-04-05 20/1000 2026-04-10 10:15 by may_新宇
[考研] 一志愿中国科学院上海有机所,有机化学356分找调剂 +11 Nadiums 2026-04-09 11/550 2026-04-09 18:04 by lijunpoly
[考研] 求助071001调剂!!! +7 黄守松 2026-04-05 8/400 2026-04-09 09:07 by 徐良白眉大侠
[考博] 材料方向考博,求推荐 +3 言语aaa 2026-04-05 4/200 2026-04-08 22:22 by nxgogo
[考研] 22408 266求调剂 +11 masss11222 2026-04-07 14/700 2026-04-08 11:06 by yulian1987
[考研] 计算机408|在校多次国家级竞赛获奖|申请调剂 +4 东山大白鹅 2026-04-05 4/200 2026-04-08 00:18 by chongya
[考研] 316求调剂 +4 15318418673 2026-04-07 4/200 2026-04-07 22:12 by hemengdong
[考研] 材料求调剂 +18 一样YWY 2026-04-05 18/900 2026-04-07 15:49 by dxlg
[考研] (调剂)一志愿报考哈尔滨工业大学0857资源与环境专业378分考生 +7 狠狠加油 2026-04-05 8/400 2026-04-06 16:52 by momo皓
[考研] 一志愿河北工业大学材料工程,初试344求专硕调剂 +6 15933906766 2026-04-05 6/300 2026-04-06 13:21 by 无际的草原
信息提示
请填处理意见