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崔永霞铁虫 (小有名气)
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[求助]
如何进行蛋白质三维结构分析 已有1人参与
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| 我手里有一个氨基酸序列，想做一下蛋白质的三维结构分析，但是不知道从何下手。请各位高手指点。 |
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崔永霞
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你好，我根据你给的网址做了在线建模分析，但是结果出来了，我看不懂啊 。http://swissmodel.expasy.org/interactive/B3r5Du/models/，能不能麻烦你再帮我看一下啊。谢谢了。 |
3楼2015-04-13 23:59:55
lxj341401
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-04-09 08:23:40
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| 对这方面不了解的话，可以SWISS-MODEL 在线建模（http://swissmodel.expasy.org/），然后根据它选择的模板的结构对建模结果进行分析；也可以自己用MODELER、Discovery Studio等软件自己建模，然后分析。 |
2楼2015-04-09 08:11:59
崔永霞
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4楼2015-04-14 00:01:08
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模板和你的序列同源性高达85%，建模结果是比较可靠的。 具体怎么看，告诉你方法：你先看选择的模板，然后从PDB数据库中找到该模板和对应的文献，再从该文献入手分析自己的结构。比如第一个结果，模板是2XZ1，对应的文献如下： Remote control of regioselectivity in acyl-acyl carrier protein-desaturases. Guy, J.E., Whittle, E., Moche, M., Lengqvist, J., Lindqvist, Y., Shanklin, J. Journal: (2011) Proc.Natl.Acad.Sci.USA 108: 16594 PubMed: 21930947 PubMedCentral: PMC3189045 DOI: 10.1073/pnas.1110221108 |
5楼2015-04-14 08:24:11
