| 查看: 4014 | 回复: 9 | ||
崔永霞铁虫 (小有名气)
|
[求助]
如何进行蛋白质三维结构分析 已有1人参与
|
| 我手里有一个氨基酸序列，想做一下蛋白质的三维结构分析，但是不知道从何下手。请各位高手指点。 |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有71人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何查找某一蛋白质结构域的结合蛋白或者基因？
已经有6人回复
- 蛋白质三级结构3D图制作问题
已经有13人回复
- 蛋白质三级结构结构模建
已经有3人回复
- pymol分析蛋白高级结构
已经有9人回复
- 求助蛋白质三维建模
已经有11人回复
- 蛋白质功能结构域保守性分析图
已经有7人回复
- 急求序列结构分析
已经有9人回复
- 蛋白质二级结构、三级结构的预测
已经有8人回复
- 关于预测蛋白质分子量、二级结构
已经有6人回复
- 同源建模，希望建的蛋白质结构，N端和C端分别使用不同的蛋白模版，请教
已经有11人回复
- 用SwissModel预测只能得到蛋白质的一大部分的三维结构，why？
已经有14人回复
- 蛋白质二级结构预测
已经有9人回复
- 关于同源建模预测蛋白三维结构
已经有4人回复
- 蛋白质三维结构预测
已经有10人回复
- 蛋白质3-d 结构预测
已经有3人回复
- 蛋白质二级结构分析
已经有12人回复
- 【求助/交流】请教各位：如何分析蛋白质的结构？
已经有4人回复
- 【求助/交流】除了swiss-model还有别的预测基因蛋白三维结构的工具吗？
已经有8人回复
- 【分享】蛋白质结构预测流程
已经有32人回复
lxj341401
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 58
- 应助: 388 (硕士)
- 贵宾: 0.238
- 金币: 17138.7
- 红花: 43
- 帖子: 2251
- 在线: 712.4小时
- 虫号: 111074
- 注册: 2005-11-20
- 专业: 生物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-04-09 08:23:40
崔永霞: 金币+6, ★★★很有帮助, 谢谢！ 2015-04-13 23:25:56
崔永霞: 金币+6, ★★★很有帮助, 非常感谢 2015-04-14 00:02:48
崔永霞: 金币+6, ★★★很有帮助, 非常感谢 2015-04-15 04:03:59
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-04-09 08:23:40
崔永霞: 金币+6, ★★★很有帮助, 谢谢！ 2015-04-13 23:25:56
崔永霞: 金币+6, ★★★很有帮助, 非常感谢 2015-04-14 00:02:48
崔永霞: 金币+6, ★★★很有帮助, 非常感谢 2015-04-15 04:03:59
| 对这方面不了解的话，可以SWISS-MODEL 在线建模（http://swissmodel.expasy.org/），然后根据它选择的模板的结构对建模结果进行分析；也可以自己用MODELER、Discovery Studio等软件自己建模，然后分析。 |
2楼2015-04-09 08:11:59
崔永霞
铁虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2349.7
- 散金: 82
- 红花: 4
- 帖子: 275
- 在线: 71.9小时
- 虫号: 1967965
- 注册: 2012-09-01
- 性别: MM
- 专业: 生物化学
|
你好，我根据你给的网址做了在线建模分析，但是结果出来了，我看不懂啊 。http://swissmodel.expasy.org/interactive/B3r5Du/models/，能不能麻烦你再帮我看一下啊。谢谢了。 |
3楼2015-04-13 23:59:55
崔永霞
铁虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2349.7
- 散金: 82
- 红花: 4
- 帖子: 275
- 在线: 71.9小时
- 虫号: 1967965
- 注册: 2012-09-01
- 性别: MM
- 专业: 生物化学
4楼2015-04-14 00:01:08
lxj341401
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 58
- 应助: 388 (硕士)
- 贵宾: 0.238
- 金币: 17138.7
- 红花: 43
- 帖子: 2251
- 在线: 712.4小时
- 虫号: 111074
- 注册: 2005-11-20
- 专业: 生物化学
|
模板和你的序列同源性高达85%，建模结果是比较可靠的。 具体怎么看，告诉你方法：你先看选择的模板，然后从PDB数据库中找到该模板和对应的文献，再从该文献入手分析自己的结构。比如第一个结果，模板是2XZ1，对应的文献如下： Remote control of regioselectivity in acyl-acyl carrier protein-desaturases. Guy, J.E., Whittle, E., Moche, M., Lengqvist, J., Lindqvist, Y., Shanklin, J. Journal: (2011) Proc.Natl.Acad.Sci.USA 108: 16594 PubMed: 21930947 PubMedCentral: PMC3189045 DOI: 10.1073/pnas.1110221108 |
5楼2015-04-14 08:24:11
崔永霞
铁虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2349.7
- 散金: 82
- 红花: 4
- 帖子: 275
- 在线: 71.9小时
- 虫号: 1967965
- 注册: 2012-09-01
- 性别: MM
- 专业: 生物化学
6楼2015-04-15 04:03:15
崔永霞
铁虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2349.7
- 散金: 82
- 红花: 4
- 帖子: 275
- 在线: 71.9小时
- 虫号: 1967965
- 注册: 2012-09-01
- 性别: MM
- 专业: 生物化学
7楼2015-04-15 04:37:38
lxj341401
至尊木虫 (著名写手)
- MolEPI: 58
- 应助: 388 (硕士)
- 贵宾: 0.238
- 金币: 17138.7
- 红花: 43
- 帖子: 2251
- 在线: 712.4小时
- 虫号: 111074
- 注册: 2005-11-20
- 专业: 生物化学
8楼2015-04-15 08:18:31
崔永霞
铁虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2349.7
- 散金: 82
- 红花: 4
- 帖子: 275
- 在线: 71.9小时
- 虫号: 1967965
- 注册: 2012-09-01
- 性别: MM
- 专业: 生物化学
9楼2015-04-15 22:21:09
10楼2018-01-13 11:50:36
