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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » Autodock的使用过程中出现的一些问题
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JJLune

木虫 (小有名气)

[求助] Autodock的使用过程中出现的一些问题 已有3人参与

各位亲，我是刚开始使用Autodock的，在使用的过程中，出现了一些问题，望各位看到这个帖子的，能够给解决一下。。。。
    我用的是Autodock 1.5.6版 其他软件都安装正确，也能正常的运行，大分子是从PDB数据库中下载的格式.pdb格式，小分子是从TCMSP数据库下载的一个化学成分格式.mol2格式；运行过程中所生成的文件全部都放在默认的文件夹中。在软件的运行过程没有一次报错的情况，但是当Run Autogrid的时候，运行的过程一闪而过，什么文件也不生成，因此在Run Autodock的时候，缺少部分文件，不能继续下去。。。。
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1楼 2015-04-03 11:32:44
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honeyzhao

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
JJLune: 金币+3 2015-04-08 19:13:17
你应该autogrid 和GPF文件都要指定路径， 在一个你可以用官方介绍的方法用命令行检查一下你是否安装正确。。。。。
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9楼2015-04-08 17:53:11
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tbw258

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
JJLune: 金币+2 2015-04-03 18:14:47
默认文件的路径呢 命令提示窗口的信息n？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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我来了~~
2楼2015-04-03 13:14:54
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JJLune

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tbw258 at 2015-04-03 13:14:54
默认文件的路径呢 命令提示窗口的信息n？

我现在能做到最后  但是当调用对接结果的时候就报错了，说是刚性文件找不到

[ 发自小木虫客户端 ]
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待我长发及腰，少年娶我可好
3楼2015-04-03 18:13:49
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tbw258

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
JJLune: 金币+3 2015-04-07 09:33:30
截图详细点？可能你的文件没整到同一文件夹

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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我来了~~
4楼2015-04-05 21:28:55
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